结论：事故协议书签完后车辆仍被扣留，可能涉及多种原因，包括但不限于事故调查需要、证据保全、车辆检验鉴定以及协议履行问题等。下面我将从这几个方面为你详细分析。
事故调查需要：
- 在交通事故发生后，交警部门有权对事故现场进行勘查，并对涉事车辆进行扣留，以便进行事故原因的调查和分析。这是为了确保事故处理的公正性和准确性，即使双方已经签订了事故协议书，如果交警部门认为仍有必要对车辆进行进一步调查，他们可能会继续扣留车辆。
证据保全：
- 车辆作为事故现场的重要证据之一，其状态、损坏情况等对于事故责任的认定具有关键作用。在事故处理过程中，为了确保证据的完整性和真实性，交警部门可能会扣留车辆作为证据保全措施。即使双方已经达成协议，但如果交警部门认为车辆的状态或损坏情况对于事故责任的认定仍有重要影响，他们可能会继续扣留车辆。
车辆检验鉴定：
- 在某些情况下，为了确定事故责任或车辆损坏程度，交警部门可能会委托专业机构对车辆进行检验鉴定。这一过程可能需要一定的时间，因此车辆可能会被继续扣留直到检验鉴定完成。
协议履行问题：
- 虽然双方已经签订了事故协议书，但如果存在一方未按照协议履行义务的情况（如未支付赔偿款等），另一方可能会向交警部门或法院申请采取保全措施，包括继续扣留车辆。这是为了确保协议的履行和受损方的权益得到保障。
建议：
- 如果你认为车辆被扣留的原因不合理或已经超过了必要的期限，你可以向交警部门咨询具体原因，并要求他们给出明确的解释和预计的车辆放行时间。
- 如果交警部门给出的解释或预计时间你不满意，你可以考虑通过法律途径来维护自己的权益，比如向法院申请复议或提起行政诉讼等。
- 同时，你也需要检查自己是否已经按照事故协议书履行了所有义务，如果存在未履行的情况，建议尽快履行以避免不必要的法律纠纷。
后续行动：
- 在处理此类问题时，建议你保留好所有与事故相关的证据和文件，包括事故协议书、交警部门的扣留通知、车辆检验鉴定报告等。
- 如果你对法律程序不熟悉或感到困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。