面对公司不配合进行劳动能力鉴定（特别是当涉及疑似职业病时）的情况，您可以采取以下详细且具有深度的步骤来维护自己的合法权益：
一、深入了解相关法律法规
首先，您需要熟悉《中华人民共和国职业病防治法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《工伤保险条例》等相关法律规定。这些法律明确规定了您在职业病诊断、鉴定过程中的权利，以及公司应承担的义务，包括但不限于知情权、诊断权、治疗权及获得赔偿的权利等。
二、全面收集相关证据
职业接触史证据：
- 劳动合同：这是证明您与公司存在劳动关系及工作岗位、内容的关键文件。
- 工资条、工作证、考勤记录：这些可以辅助证明您的工作情况及接触职业病危害因素的时长和经历。
职业病危害接触证据：
- 工作场所环境监测数据：如空气中有害物质浓度检测报告，您可以向公司要求提供，或者请求安全生产监督管理部门进行检测。
- 同事证言：寻找同事作为证人，证明您在工作过程中接触到的职业病危害因素情况。
- 医疗记录：如果您已经出现相关症状并就医，保留好所有的医疗记录，包括诊断书、检查报告等。
三、与公司进行正式沟通协商
- 书面沟通：以邮件、挂号信等书面形式向公司表达您拟患职业病的情况及希望公司配合进行鉴定的诉求，并明确告知公司其法律义务。保留好沟通凭证，以备后续使用。
- 寻求工会帮助：如果公司有工会组织，您可以向工会反映情况，请求工会介入协调，推动公司配合进行鉴定。
四、寻求政府部门帮助
- 劳动监察部门投诉：向当地的劳动监察部门提交相关证据，说明公司不配合鉴定的情况。劳动监察部门有权对公司进行调查，并责令公司改正其违法行为。
- 卫生健康部门反映：卫生健康部门负责职业病防治的监管工作，您可以向其反映问题，请求卫生健康部门推动鉴定工作的进行。
五、自行申请职业病鉴定
即使公司不配合，您仍有权自行向用人单位所在地、户籍所在地或经常居住地的职业病诊断机构提出诊断申请。在申请时，您需要按照要求提供相关的材料，如职业接触史、职业病危害接触证据等。
六、通过法律途径维权
- 劳动仲裁或诉讼：如果您被确诊为职业病，但公司拒绝承担责任，您可以通过劳动仲裁或诉讼来维权。在仲裁或诉讼过程中，您需要提交充分的证据来证明公司的不配合行为及其对自身权益造成的损害。
- 法律援助：如果您在维权过程中遇到经济困难或其他特殊情况，可以向法律援助机构申请援助，以获得专业的法律帮助。
七、加强职业健康保护意识
在未来的工作中，您应定期进行体检和监测，及时发现和处理潜在的职业病风险。同时，增强自我保护意识，了解并掌握基本的职业病预防知识，以降低患职业病的风险。
在整个过程中，保持冷静、理性是非常重要的。注重证据的收集和保存，是成功维权的关键。希望这些建议能够帮助您有效应对公司不配合进行劳动能力鉴定的问题，维护自己的合法权益。