是的，工作单位一般应该填写聘用合同上的甲方。以下是对这一问题的详细分析：
合同关系的基本理解：
- 在聘用合同中，甲方通常是雇佣方，即工作单位；乙方则是被雇佣方，即劳动者。这是合同关系中的基本设定，明确了双方的权利和义务。
工作单位填写的依据：
- 聘用合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。因此，在填写工作单位时，自然应当填写聘用合同上的甲方，即实际雇佣劳动者的单位。
实际操作中的注意事项：
- 核对合同内容：在填写工作单位前，务必仔细核对聘用合同的内容，确保甲方信息准确无误。
- 保持一致性：在后续的工作过程中，如填写各类表格、申请等，涉及工作单位的信息时，都应保持与聘用合同上的一致，以避免不必要的麻烦。
- 法律后果：如果因填写错误或故意隐瞒工作单位信息而导致法律纠纷或损失，相关责任方可能需要承担相应的法律责任。
特殊情况的处理：
- 如果聘用合同中的甲方并非实际工作单位（例如，存在劳务派遣、挂靠等情形），那么在填写工作单位时，应根据实际情况进行填写，并可能需要额外说明或提供相关证明材料。但这种情况相对特殊，且可能涉及更复杂的法律关系，建议在此类情况下咨询专业律师以获取准确指导。
建议：在填写工作单位时，务必以聘用合同上的甲方信息为准，并仔细核对合同内容以确保准确性。如果遇到特殊情况或不确定如何填写，可以及时向我咨询以获取专业法律意见。