结论：甲方工地证不齐全的情况下，乙方收取下面班组的钱是否合法合规，不能一概而论，需要分情况讨论。

分析：

1. 从合同关系角度：

   • 如果乙方与下面班组之间存在明确的合同关系，且合同中规定了乙方有权收取相关费用（如管理费、保证金等），那么乙方收取费用可能是基于合同约定的，此时甲方工地证是否齐全，并不直接影响乙方与班组之间合同的有效性。但需注意，如果合同内容本身违法或违反公序良俗，则合同无效，乙方收取费用也将失去合法依据。
   • 如果乙方与下面班组之间没有明确的合同关系，或者合同中没有规定乙方有权收取费用，那么乙方擅自收取费用可能构成不当得利或违法行为，此时甲方工地证是否齐全，并不改变乙方行为的违法性。

2. 从工地证齐全与否的影响角度：

   • 甲方工地证不齐全，可能涉及违法建设、违规施工等问题，但这主要影响的是甲方与相关部门（如建设局、城管等）之间的法律关系，以及甲方可能面临的行政处罚或法律责任。
   • 乙方作为施工方或管理方，其收取下面班组费用的行为，与甲方工地证是否齐全无直接关联。除非乙方收取费用的行为本身与甲方工地证不齐全有直接因果关系（如乙方以甲方工地证不齐全为由，向班组收取“疏通关系”的费用等），否则甲方工地证不齐全不能成为乙方收取费用的合法理由。

3. 从法律合规性角度：

   • 乙方收取下面班组费用，必须遵守相关法律法规的规定，如《合同法》、《民法典》中关于合同效力、不当得利等规定，以及建筑行业的相关管理规定。
   • 如果乙方收取费用的行为违反了法律法规的规定，或者损害了班组的合法权益，那么该行为将受到法律的制裁或纠正。

建议：

• 对于乙方而言，在收取下面班组费用前，应确保与班组之间存在明确的合同关系，并明确约定费用的性质、金额、支付方式等条款。同时，应遵守相关法律法规的规定，确保收取费用的行为合法合规。
• 对于甲方而言，应尽快完善工地证件，确保施工活动的合法性和合规性。同时，应加强对乙方的管理和监督，防止乙方擅自收取费用或进行其他违法行为。
• 如果双方对费用收取问题存在争议或纠纷，建议及时咨询专业律师或相关机构进行调解或仲裁，以维护双方的合法权益。

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