结论：本院刚退休的干警作为原告在本院提起诉讼，主张向第三人偿还借款，本院在一般情况下是可以处理的，但需遵循回避制度的相关规定，确保审判的公正性。

分析说明：

1. 法院管辖权：

   • 根据一般的法律原则，法院对在其管辖范围内的案件具有审理权。退休干警作为原告，其提起的诉讼若属于本院管辖范围，且符合起诉条件，本院自然有权受理。

2. 回避制度：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，审判人员、书记员、翻译人员、鉴定人、勘验人等与案件有利害关系或其他可能影响公正审判的关系时，应当回避。
   • 应用情况：在此案例中，若退休干警在本院工作期间与案件中的任何一方（包括第三人）存在直接或间接的利害关系，或者其退休前的职务、行为可能影响案件的公正审理，那么相关审判人员应当回避。但回避的是具体的审判人员，而非整个法院。只要法院能确保审判的公正性，即安排与案件无利害关系的审判人员进行审理，本院就可以处理该案件。

3. 实际操作：

   • 在实际操作中，法院会严格审查案件情况，包括原告、被告及第三人的身份关系、案件事实等，以确定是否存在需要回避的情形。
   • 若存在回避情形，法院会及时更换审判人员，确保案件的公正审理。
   • 若不存在回避情形，法院则会依法受理并审理案件。

特殊场景：

• 若退休干警在本院工作期间与案件存在特殊关系（如曾直接参与过与案件相关的处理工作），且这种关系可能影响案件的公正审理，那么除了审判人员需要回避外，法院也可能需要考虑是否将案件移送至其他法院审理，以进一步确保审判的公正性。但这种情况较为特殊，且需根据具体案件情况来判断。

建议与行动：

• 对于退休干警作为原告在本院提起诉讼的情况，建议法院在受理前进行严格的审查，确保不存在需要回避的情形。
• 若存在回避情形，应及时更换审判人员或考虑将案件移送至其他法院审理。
• 原告和被告也应积极配合法院的审查工作，提供必要的证据和信息，以便法院能够准确判断是否存在回避情形。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律解答和建议。