民办非企业被列入异常名录期间，原则上可以更换理事长，但需分情况讨论，且更换程序可能因异常状态受到一定限制或需履行额外义务。具体分析如下：

1. 法律层面：更换理事长的权利未被直接剥夺

根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》及《社会组织登记管理机关行政处罚程序规定》，民办非企业的理事长（法定代表人）变更属于内部治理事项，法律未明确禁止被列入异常名录的单位办理变更登记。异常名录主要影响单位的信用评价和部分行政许可（如年检、政府购买服务资格），但不影响其作为民事主体的基本权利，包括内部人事调整。

2. 实务层面：更换程序可能受异常状态影响

尽管法律未禁止变更，但实务中需注意以下限制：

• 登记机关审查趋严：部分地区登记管理机关可能要求民办非企业在解除异常状态（如补报年报、整改违规行为）后，再办理理事长变更登记，以避免“带病换人”导致责任主体模糊。
• 材料要求增加：申请变更时，除常规文件（如理事会决议、新理事长身份证明）外，可能需额外提交《异常状态整改报告》或登记机关要求的其他证明材料，以证明单位已具备正常运营能力。
• 公示期延长：变更信息公示期间，若单位仍处于异常状态，可能引发公众对单位治理稳定性的质疑，影响新理事长的履职声誉。

3. 风险防范建议

• 优先解除异常状态：若条件允许，建议先完成异常名录移出程序（如补报年报、缴纳罚款、整改违规行为），再启动理事长变更，以降低程序阻力。
• 与登记机关提前沟通：变更前向属地民政部门或登记管理机关咨询具体要求，确认是否需同步提交整改材料或接受现场核查。
• 完善内部决策程序：确保理事会决议合法有效（如符合章程规定的表决比例），避免因程序瑕疵导致变更被驳回。
• 关注新理事长资格：新任理事长需符合《民办非企业单位登记管理暂行条例》规定的任职资格（如无犯罪记录、未被列入失信名单等），否则变更申请可能被否决。

总结：民办非企业被列入异常名录期间可更换理事长，但需结合当地登记管理机关的具体要求操作，建议优先整改异常问题以降低风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体流程或地区差异。