当民事案件的被告在看守所时，诉讼程序会有一些特别的安排和处理方式，但法院会依法确保被告的各项诉讼权利得到充分保障，并依据案件事实和法律规定作出公正的判决和执行。以下是从多个角度对此问题的详细分析：
一、诉讼文书的送达
直接送达：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，如果受送达人在监禁中，法院会通过其所在的监所进行转交。具体操作上，法院会安排法警等工作人员前往看守所，并在看守所工作人员的配合下，将起诉状副本、传票等诉讼文书直接交给被告。这种方式确保了被告能够及时收到诉讼文书，了解诉讼情况。
委托送达：
- 若直接送达存在困难，如法院工作人员无法及时前往看守所，法院还可以选择委托看守所代为送达诉讼文书。看守所将按照相关规定和程序，确保文书及时、准确地转交给被告。这种方式提高了送达效率，保障了诉讼程序的顺利进行。
二、开庭审理的特别安排
看守所内开庭：
- 在与看守所协商并得其配合后，法院可以在看守所内设立临时法庭进行开庭审理。这种方式既保障了被告能够参加诉讼，行使其辩护权利，又确保了庭审的正常进行。特别是在涉及刑事案件附带民事赔偿的案件中，这种安排尤为常见。
视频开庭：
- 考虑到实际情况和安全因素，以及技术条件的不断进步，法院也可以选择通过视频会议系统等方式进行远程开庭。被告在看守所内通过专门的设备参与庭审，实现与原告、法官及其他诉讼参与人的实时视频连线。这种方式在疫情防控期间尤为适用，有效减少了人员聚集和流动，同时保障了庭审的顺利进行。
被告无法出庭的处理：
- 如果因特殊原因被告无法出庭，如健康原因或看守所管理规定等，法院将根据案件的具体情况和现有证据进行缺席判决。但此情况下，法院会确保被告的诉讼权利得到充分保障，如提前通知被告并听取其意见等。同时，被告也有权在事后对判决提出异议或上诉。
三、被告权利的全面保障
- 被告在看守所并不影响其依法享有的各项诉讼权利。这包括但不限于委托代理人、进行答辩、举证、质证、辩论等。被告可以通过家属代为聘请律师，或者向法律援助机构申请法律援助。如果被告因经济困难无法聘请律师，其家属可以向当地法律援助机构提出申请，由法律援助机构指派律师为其提供法律服务。律师在接受委托后，有权前往看守所会见被告，了解案情，并提供专业的法律建议。
四、判决和执行的相关事宜
判决：
- 法院会根据案件事实和法律规定作出公正的判决。如果被告对判决不服，可以在法定上诉期限内通过看守所工作人员向法院提交上诉状，提起上诉。法院将依法审查并处理被告的上诉请求，确保被告的合法权益得到保障。
执行：
- 若被告败诉且需要履行赔偿等义务，判决生效后，执行程序可能会受到被告在看守所的特殊情况影响。如果被告有可供执行的财产，法院可以依法对其财产进行执行；如果被告暂时没有财产可供执行，法院会在其出狱后继续执行，以确保判决得到切实履行。同时，法院也会考虑被告的实际情况和履行能力，合理确定执行方式和期限。
总结与建议：
当民事案件的被告在看守所时，诉讼程序虽然会有一些特别的安排和处理方式，但法院会依法确保被告的各项诉讼权利得到充分保障。作为原告或被告的家属，您应积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以便法院能够公正、高效地处理案件。如果您在诉讼过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律服务。