特殊工时制下，员工是否应获得补偿，这主要取决于具体的情况和相关的法律法规规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、特殊工时制的定义与类型
特殊工时制是相对于标准工时制而言的，它主要包括不定时工作制和综合计算工时工作制两种。不定时工作制是指因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。综合计算工时工作制则是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用的以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。
二、特殊工时制下的补偿情况
不定时工作制：
- 在不定时工作制下，员工的工作时间不受固定限制，因此通常不涉及加班费的问题。但是，如果员工在法定节假日工作，根据《劳动法》的相关规定，员工有权获得加班费或补休。
- 此外，如果企业因工作需要安排员工在休息日工作，且无法安排补休的，也应按照法律规定支付加班费。
综合计算工时工作制：
- 在综合计算工时工作制下，员工的工作时间是在一个周期内综合计算的。如果在这个周期内，员工的总工作时间超过了法定标准工作时间，那么超出的部分应视为加班，企业应按照法律规定支付加班费。
- 同样，如果员工在法定节假日工作，也有权获得加班费或补休。
三、特殊工时制下的补偿标准
- 加班费计算：根据《劳动法》的规定，员工在法定节假日工作的，加班费应不低于工资的百分之三百；在休息日工作且无法安排补休的，加班费应不低于工资的百分之二百。
- 补休安排：如果企业因工作需要安排员工在休息日工作，且能够安排补休的，那么可以安排员工在其他时间补休，而不支付加班费。但是，补休的时间应与员工实际工作的时间相等。
四、实际操作中的注意事项
- 合同约定：企业在与员工签订劳动合同时，应明确约定工时制度、工作时间、加班费支付等事项，以避免后续纠纷。
- 审批备案：企业实行特殊工时制，应经过劳动行政部门的审批备案，确保合法合规。
- 记录保存：企业应妥善保存员工的工作时间记录、加班记录等，以备查验。
总结来说，特殊工时制下员工是否应获得补偿，取决于具体的工作时间安排、是否涉及法定节假日或休息日工作等因素。企业应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。如果你对特殊工时制下的补偿问题还有疑问，或者需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。