未办理施工许可证便进行厂房建设是违反我国相关法律法规的行为，可能会面临一系列严重的法律后果。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、行政处罚
责令改正：
- 根据《中华人民共和国建筑法》第七条及《建筑工程施工许可管理办法》的相关规定，建筑工程开工前，建设单位必须向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证。若未办理施工许可擅自施工，建设行政主管部门会责令建设单位立即停止施工，并要求在规定期限内补办施工许可证。
罚款：
- 依据《建筑工程施工许可管理办法》第十二条，未取得施工许可证或规避办理施工许可证擅自施工的，发证机关将责令停止施工，限期改正，并对建设单位处工程合同价款1%以上2%以下的罚款，对施工单位处3万元以下的罚款。这一罚款力度旨在惩罚违法行为，并促使建设单位和施工单位遵守法律法规。
二、刑事责任
- 在极端情况下，如果未办理施工许可擅自施工的行为情节严重，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。这通常涉及更严重的违法行为，如造成重大安全事故或严重损害公共利益等。
三、影响工程合法性及后续权益
无法办理竣工验收备案：
- 未办理施工许可的项目可能无法通过正常的竣工验收备案程序。竣工验收备案是建筑物正式投入使用及后续产权登记的重要环节，缺乏这一环节将影响建筑物的合法性和正常使用。
合同效力风险：
- 与未办理施工许可的建设项目相关的施工合同等可能被认定为无效合同。这可能导致法律纠纷和经济损失，因为无效合同不受法律保护，双方可能无法依据合同条款主张权利或承担义务。
四、应对措施与建议
及时补办手续：
- 如果发现未办理施工许可而已经开始建设，建设单位应立即停止施工，并按照规定程序和要求准备好相关材料，向建设行政主管部门申请补办施工许可证。这是避免进一步法律后果的关键步骤。
积极配合整改：
- 在主管部门责令改正的过程中，建设单位和施工单位应积极配合，落实整改措施，以尽快达到合法施工的条件。这有助于减少罚款和其他不利后果的可能性。
加强法律意识与合规管理：
- 建设单位和施工单位应加强对相关法律法规的学习和理解，确保在建设活动中遵守法律法规要求。同时，建立完善的合规管理制度，确保所有建设活动都经过合法审批和许可。
总结来说，未办理施工许可证便进行厂房建设是严重的违法行为，可能面临行政处罚、刑事责任以及影响工程合法性及后续权益等多重后果。因此，我强烈建议在进行任何建设活动之前，务必确保已经按照法定程序办理了施工许可证。如果你正在面临这样的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和指导。