未办理建设施工许可证擅自施工，将面临一系列严重的法律后果和经济损失，具体危害如下：
一、行政法方面的危害
责令停止建设与限期改正
- 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》及《中华人民共和国建筑法》的相关规定，未取得建设工程规划许可证或施工许可证擅自施工的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门或建筑行政主管部门责令停止施工，并限期改正。
- 实例说明：比如某开发商在未取得相关许可的情况下擅自开工，结果被相关部门责令立即停止施工，并根据情况限期整改，这不仅延误了工期，还增加了额外的整改成本。
罚款
- 法律依据：依据《中华人民共和国建筑法》、《建设工程质量管理条例》及《建筑工程施工许可管理办法》，未取得施工许可证擅自施工的，通常会被处以工程合同价款一定比例（如1%至2%）的罚款。
- 实例说明：某企业因未取得施工许可擅自建厂，根据工程造价被处以了相应比例的罚款，这无疑增加了企业的经济负担。
工程拆除与没收
- 法律依据：对于无法采取改正措施消除影响的违法建筑，相关部门将依法限期拆除；不能拆除的，则没收实物或违法收入，并可并处罚款。
- 实例说明：某单位在保护区内违规建设，因严重影响规划且无法整改，最终被责令限期拆除，造成了巨大的经济损失。
对相关责任人的处罚
- 法律依据：根据《建筑工程施工许可管理办法》，对未取得施工许可证擅自施工的建设单位、施工单位等，除对单位处罚外，还对相关责任人给予警告、罚款等行政处罚。
- 实例说明：某建设项目因赶工期未取证擅自开工，结果建设单位和施工单位及相关责任人均受到了警告和罚款的处罚。
二、民法方面的危害
合同无效
- 法律依据：根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》，未取得建设许可或施工主体资质不符的，建设工程施工合同可能被认定无效。
- 实例说明：某无资质施工企业承接项目并未取得建设许可，其签订的施工合同最终被法院认定为无效，导致企业无法获得应有的工程款。
承担赔偿责任
- 法律依据：因合同无效或违法行为给对方造成损失的，应承担赔偿责任。
- 实例说明：因建设单位未取证导致工程停工，施工单位因此遭受的损失可由建设单位赔偿，这无疑增加了建设单位的法律风险和经济负担。
三、刑法方面的危害
- 工程重大安全事故罪
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第一百三十七条，违反国家规定降低工程质量标准，造成重大安全事故的，对直接责任人员依法追究刑事责任。
- 实例说明：某建设项目未取证擅自施工且违反安全标准，导致建筑物倒塌造成伤亡，相关责任人最终被追究了刑事责任，这不仅影响了个人前途，也给企业带来了严重的声誉损失。
四、其他方面的危害
- 信誉受损：未办理施工许可证擅自施工的行为将被记录在建筑市场信用体系中，对建设单位、施工单位等责任主体的信誉造成负面影响，进而影响企业在后续工程投标、资质升级等方面的竞争力。
- 工程后续问题：擅自施工可能导致工程在规划、设计、质量安全等方面存在隐患，可能不符合法律法规和技术标准。在后续的验收、交付使用等环节，工程可能面临诸多问题，甚至需要进行整改或拆除，从而造成更大的经济损失。
建议与措施：
- 严格遵守法规：建设单位和个人在施工前必须了解并遵守相关建筑法规，确保取得所有必要的许可和批准文件。
- 及时申请许可：提前规划并申请施工许可证等开工所需文件，避免因延误而导致违法施工。
- 沟通与合作：如遇特殊情况无法及时取得许可，应与相关部门积极沟通，寻求合法合规的解决方案。
- 风险防控：建立健全风险防控机制，定期自查自纠，及时发现并纠正违规行为。
综上所述，未办理建设施工许可证擅自施工将面临严重的法律后果和经济损失。因此，务必严格遵守相关法律法规，确保工程建设的合法性与合规性。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。