未办理施工许可证擅自施工，违反了《中华人民共和国建筑法》及相关法律法规，将面临一系列严重的法律后果。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国建筑法》第六十四条：
- 违反本法规定，未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的，责令改正，对不符合开工条件的责令停止施工，可以处以罚款。
《建筑工程施工许可管理办法》第十二条：
- 对于未取得施工许可证或者为规避办理施工许可证将工程项目分解后擅自施工的，由有管辖权的发证机关责令停止施工，限期改正，对建设单位处工程合同价款1%以上2%以下罚款；对施工单位处3万元以下罚款。
二、法律后果
责令改正与停工：
- 一旦发现未办理施工许可证擅自施工，建设主管部门将立即责令改正，即要求立即停止违法行为，并限期补办施工许可证等相关手续。若不符合开工条件，还将责令停止施工。
罚款：
- 根据违规情节的严重程度，建设单位可能面临工程合同价款1%以上2%以下的罚款，施工单位则可能被处以3万元以下的罚款。这些罚款数额可能因具体案件和地区而有所不同，但都将给违规者带来不小的经济压力。
信誉受损：
- 未办理施工许可证擅自施工的行为将被记录在建筑市场信用体系中，对建设单位、施工单位等责任主体的信誉造成负面影响。这可能导致企业在后续工程投标、资质升级等方面面临困难，甚至影响企业的长期发展。
工程后续问题：
- 擅自施工可能导致工程在规划、设计、质量安全等方面存在隐患，可能不符合法律法规和技术标准。在后续的验收、交付使用等环节，工程可能面临诸多问题，甚至需要进行整改或拆除，从而造成更大的经济损失和时间成本。
三、特殊情况与例外
- 小型工程例外：根据《中华人民共和国建筑法》第七条，工程投资额在30万元以下或建筑面积在300平方米以下的建筑工程，以及国务院规定的限额以下的小型工程，可以不申请办理施工许可证。但这一例外并不适用于所有情况，具体还需根据当地政府的规定和实际情况来判断。
四、补救措施与建议
立即停工并报告：
- 若发现未办理施工许可证已擅自施工，应立即停止施工，并向当地建设行政主管部门报告情况，说明原因。这有助于减少违法行为带来的进一步影响。
尽快补办手续：
- 尽快按照要求补齐相关资料，申请办理施工许可证。在补办过程中，应积极配合主管部门的工作，以争取尽快获得许可。
加强法律意识与合规管理：
- 建设单位和施工单位应加强对相关法律法规的学习和理解，提高法律意识。同时，应建立完善的合规管理制度，确保在工程施工过程中严格遵守相关法律法规和规定。
总结来说，未办理施工许可证擅自施工是严重的违法行为，将面临责令改正、罚款、信誉受损及工程后续问题等一系列严重法律后果。因此，我强烈建议所有建设单位和施工单位在开工前务必依法依规办理施工许可证，以确保工程的合法性和安全性。如果您在建设工程领域遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。