针对您提出的“企业人员违法留置怎么处理”的问题，这主要涉及到监察机关的调查程序以及国有企业管理人员违法处分的程序。以下是我为您提供的详细解答：

一、监察机关的留置措施

根据监察法草案征求意见稿及相关规定，留置是监察机关调查严重职务违法和职务犯罪的重要手段。当企业人员（特别是国有企业管理人员）涉嫌贪污贿赂、失职渎职等严重职务违法或者职务犯罪，且监察机关已经掌握其部分违法犯罪事实及证据，仍有重要问题需要进一步调查时，若存在涉及案情重大复杂、可能逃跑自杀、可能串供或伪造销毁证据、可能有其他妨碍调查行为等情形，经监察机关依法审批，可以将其留置在特定场所。

留置措施的使用条件、审批程序、使用期限及被留置人员的合法权利保障：

1. 使用条件：必须满足上述涉嫌严重职务违法或犯罪，且存在特定情形之一。
2. 审批程序：省级以下监察机关采取留置措施，需由监察机关领导人员集体研究决定，并报上一级监察机关批准；省级监察机关决定采取留置措施，则需报中华人民共和国监察委员会备案。
3. 使用期限：留置时间一般不得超过三个月，特殊情况下可延长一次，但延长时间也不得超过三个月，即最长不得超过六个月。
4. 合法权利保障：监察机关应保障被留置人员的饮食、休息，提供医疗服务；讯问被留置人员应合理安排讯问时间和时长；采取留置措施后，除有碍调查的，应在二十四小时以内通知被留置人所在单位或家属；留置期限应当折抵刑期。

二、国有企业管理人员违法处分的程序

若企业人员为国有企业管理人员，且涉嫌违法，则还需遵循《国有企业管理人员处分条例》规定的处分程序：

1. 初步核实：经任免机关、单位负责人同意，由承办部门对需要调查处理的问题线索进行初步核实。
2. 立案：经初步核实，认为涉嫌违反公职人员政务处分法和本条例规定，需要进一步查证的，经任免机关、单位主要负责人批准同意后立案，并书面告知被调查人及其所在单位，向有管理权限的监察机关通报。
3. 进一步调查：承办部门负责收集、查证有关证据材料，向有关单位和人员了解情况，并形成书面调查报告。
4. 告知与申辩：将调查认定的事实以及拟给予处分的依据告知被调查人，听取其陈述和申辩，并对其提出的事实、理由和证据进行核实。
5. 处理建议与决定：承办部门经审查提出处理建议，按程序报任免机关、单位领导成员集体讨论，作出给予处分、免予处分、不予处分或者撤销案件的决定。
6. 通知与宣布：任免机关、单位应将处分决定以书面形式通知被调查人及其所在单位，并在一定范围内宣布。
7. 复核与申诉：被处分人对处分决定不服的，可以提出复核申请或申诉，原处分决定单位或申诉机关应依法进行复核或申诉处理。

综上所述，企业人员违法留置的处理需遵循监察机关的留置措施规定及国有企业管理人员违法处分的程序。在处理过程中，应严格依法办事，保障被调查人的合法权利，确保调查的公正性和合法性。