新的判决在一般情况下不能直接否认原来调解协议认定的事实，但在特定条件下可以间接影响或推翻原调解协议中的事实认定。以下从不同角度为您详细分析：

1. 调解协议的法律效力

   • 调解协议是双方当事人在自愿、平等的基础上，通过协商达成的解决纠纷的协议。一旦达成并经法院确认或制作调解书，即具有法律效力，对双方当事人具有约束力。
   • 调解协议中的事实认定，通常是双方当事人对案件事实的共同认可，是调解协议成立的基础。因此，在一般情况下，调解协议中的事实认定应当被尊重和执行。

2. 判决与调解协议的关系

   • 判决是法院对案件进行审理后，根据法律规定和案件事实作出的具有法律效力的裁决。判决与调解协议是两种不同的纠纷解决方式，它们各自具有独立的法律效力。
   • 新的判决通常是对新案件或原案件新情况的审理结果，它并不直接涉及或评价原调解协议中的事实认定。因此，新的判决本身并不能直接否认原调解协议中的事实。

3. 特定条件下判决对调解协议事实认定的影响

   • 再审程序：如果原调解协议存在法定再审情形，如调解违反自愿原则、调解协议内容违法等，当事人可以通过再审程序申请撤销或变更原调解协议。在再审程序中，法院会重新审理案件事实，并可能作出与原调解协议不同的事实认定。
   • 新证据出现：如果在新的诉讼中出现了新的证据，该证据足以推翻原调解协议中的事实认定，那么法院在审理新案件时，可能会根据新证据作出与原调解协议不同的事实认定。但这种情况并不直接否认原调解协议的法律效力，而是基于新证据对案件事实进行了重新认定。
   • 法律适用变化：如果法律适用发生了变化，导致原调解协议中的事实认定在新的法律框架下不再成立，那么法院在审理相关案件时，可能会根据新的法律适用对案件事实进行重新认定。但这种情况同样不直接否认原调解协议的法律效力，而是基于法律适用的变化对案件事实进行了重新解读。

4. 法律建议

   • 如果您认为原调解协议中的事实认定存在错误或需要变更，建议首先通过合法途径（如再审程序）申请撤销或变更原调解协议。
   • 在新的诉讼中，如果希望推翻原调解协议中的事实认定，需要提供充分的证据支持自己的主张，并确保这些证据符合法律规定的证据形式和证明力要求。
   • 在任何情况下，都应当尊重法院的判决和调解协议的法律效力，避免采取非法手段试图改变已经生效的法律文书。

总结来说，新的判决在一般情况下不能直接否认原来调解协议认定的事实，但在特定条件下（如再审程序、新证据出现、法律适用变化等）可以间接影响或推翻原调解协议中的事实认定。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。