结论：一般情况下，不能仅因老婆把钱转给怀疑是小三的父亲就直接开调查令查开房记录。
法律背景与解释：
调查令的申请条件：
- 调查令通常是在诉讼过程中，由法院根据当事人的申请，向有关单位或个人签发的，用于调查收集与案件有关的证据的一种法律文书。
- 申请调查令需要满足一定的条件，如申请人必须是诉讼当事人或其诉讼代理人，且需要提供初步的证据证明所调查的事项与案件有关联等。
开房记录的隐私性：
- 开房记录属于个人隐私信息，受到法律的保护。未经法定程序，任何单位或个人不得擅自查询或泄露他人的开房记录。
- 即使怀疑存在不正当关系，也不能直接以此为由申请调查令查询开房记录。
转账记录与开房记录的关联性：
- 转账记录只能证明资金流动的情况，并不能直接证明存在不正当关系或开房行为。
- 要查询开房记录，通常需要提供更直接的证据或线索，如具体的开房时间、地点、人员信息等，且这些信息需要与案件有直接的关联性。
法律建议：
收集更多证据：
- 如果怀疑存在不正当关系，应该通过合法途径收集更多证据，如聊天记录、照片、视频等，这些证据可能更直接地证明存在不正当关系。
- 转账记录可以作为辅助证据，但单独使用可能不足以支持申请调查令查询开房记录。
考虑诉讼策略：
- 如果决定通过法律途径解决纠纷，应该咨询专业律师，制定合适的诉讼策略。
- 律师可以根据具体情况，评估证据的充分性和关联性，以及申请调查令的可行性和风险。
尊重隐私和法律程序：
- 在处理此类纠纷时，应该尊重他人的隐私权和法律程序。
- 避免采取非法手段获取证据或侵犯他人隐私，否则可能面临法律责任。
可能的法律后果：
- 如果未经法定程序擅自查询或泄露他人的开房记录，可能构成侵犯他人隐私权，需要承担相应的法律责任。
- 如果申请调查令时提供虚假证据或隐瞒重要事实，可能影响法院的判断，甚至导致申请被驳回或承担其他法律后果。
进一步思考：
- 在处理婚姻家庭纠纷时，应该注重证据的合法性和关联性，避免采取过激或非法的手段。
- 如果怀疑存在不正当关系或财产转移等问题，应该及时咨询专业律师，制定合适的法律策略来维护自己的合法权益。
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