结论前置：公司与员工协商离职时，赔偿金的数额主要取决于工作年限、月工资标准以及谁主动提出的解除劳动合同。若公司主动提出，应支付经济补偿；若员工以个人原因主动提出，则公司一般无需支付。以下是详细分析：
一、经济补偿金的基本计算规则
按工作年限计算：
- 每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
- 六个月以上不满一年的，按一年计算。
- 不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
月工资的定义：
- 月工资是指劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。
计算公式：
- 经济补偿金 = 工作年限 × 月工资
- 其中，工作年限按上述规则折算为整数或半年；月工资为前十二个月的平均工资。
二、特殊情况的封顶规定
- 若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿金的标准按职工月平均工资三倍的数额支付。
- 在此情况下，支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
计算公式（以月工资超过封顶标准为例）：
- 经济补偿金 = 12年 × 当地上年度职工月平均工资三倍
三、谁提出解除的影响
公司主动提出：
员工主动提出（个人原因）：
- 公司一般不需要支付经济补偿金。但若员工因公司存在过错（如未按时足额支付工资、未提供约定的劳动条件等）而提出辞职并与公司协商一致的，员工有权要求公司支付经济补偿。
四、详细示例分析
一般情况示例：
- 假设小李在某公司工作了3年，月平均工资为8000元，且未超过当地上年度职工月平均工资的三倍。那么，公司与他协商解除劳动合同时应支付的经济补偿金为：3年 × 8000元/年 = 24000元。
特殊情况示例（月工资超过封顶标准）：
- 假设某员工在公司工作了5年，其月平均工资为40000元，而当地上年度职工月平均工资的三倍为30000元。由于该员工的月工资超过了封顶标准，因此其经济补偿金的计算基数将按照30000元计算，且支付年限最高不超过十二年。所以，该员工应获得的经济补偿金为：12年 × 30000元/年 = 360000元（尽管实际工作年限只有5年，但由于月工资超过了封顶标准，所以按最高年限12年计算）。
五、其他可能的赔偿
代通知金：
- 如果公司未提前三十日以书面形式通知员工解除劳动合同，需额外支付一个月工资作为代通知金。
未休年假和加班工资补偿：
- 根据实际未休年假和加班情况，公司可能还需支付相应的补偿。
六、建议与注意事项
签订书面协议：
- 无论哪一方提出协商解除劳动合同，双方就赔偿事宜达成一致后，应签订书面的解除劳动合同协议，明确解除时间、经济补偿金额、支付方式及时间等重要条款，以避免后续纠纷。
了解当地政策：
- 由于经济补偿金的计算可能受到当地上年度职工月平均工资的影响，因此建议双方在协商前了解清楚当地的相关政策。
依法维权：
- 若公司未按规定支付经济补偿或其他赔偿，员工可向劳动争议仲裁机构或人民法院申请维权。
在实际操作中，公司和员工应充分沟通，确保赔偿方案的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。