国有产权交易合同在发生重大变更时，经政府同意后是可以签订补充协议的，但需满足法定条件和程序要求。以下从不同角度展开分析：

1. 法律依据与合同变更的合法性

根据《企业国有资产交易监督管理办法》（国资委、财政部令第32号）及相关规定，国有产权交易需遵循公开、公平、公正原则，交易合同是交易行为的核心法律文件。若合同履行过程中出现重大变更（如交易标的、价款、支付方式、权利义务等核心条款的调整），需符合以下条件：

• 法定变更事由：变更需基于不可抗力、政策调整、交易双方协商一致等合法事由；
• 审批程序：国有产权交易合同变更通常需报原审批机构（如国资监管机构）同意，尤其是涉及重大变更时，审批是前置程序；
• 公开透明：若变更涉及交易条件调整，可能需重新履行公开交易程序（如挂牌、拍卖等），以确保国有资产保值增值。

结论：若重大变更已获政府（国资监管机构）书面同意，且符合法定程序，签订补充协议是合法有效的。

2. 补充协议的效力与风险控制

补充协议作为原合同的附件，其效力依赖于主合同及审批程序的合法性。需注意：

• 内容明确性：补充协议应详细列明变更内容、原因、对价调整（如有）及双方权利义务，避免模糊表述；
• 审批文件留存：需保留政府同意变更的书面文件（如批复、会议纪要等），作为补充协议生效的依据；
• 公示与备案：部分交易可能要求补充协议向产权交易机构备案或公示，以确保程序合规。

风险提示：若未履行审批程序或变更内容损害国有资产权益，补充协议可能被认定无效，甚至引发监管问责。

3. 实务操作建议

• 提前沟通：在签订补充协议前，与国资监管机构充分沟通，明确变更的可行性和审批要求；
• 法律审查：委托律师对补充协议进行合规审查，确保内容不违反《民法典》《企业国有资产法》等规定；
• 程序合规：严格按审批流程操作，避免“先斩后奏”或变相规避公开交易程序。

总结：国有产权交易合同重大变更需以政府同意为前提，补充协议的签订是合法路径，但务必确保程序合规、内容明确。如有具体案例或条款需进一步分析，可直接向我咨询。