结论：软伤二级因证据不足不起诉，申诉到上级检察院后能否公诉，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：

一、证据不足不起诉的基本含义

在刑事诉讼中，证据不足不起诉是指检察机关在审查起诉阶段，认为现有证据不足以支持对犯罪嫌疑人的指控，从而决定不起诉的一种处理方式。这通常意味着，根据目前的证据情况，无法证明犯罪嫌疑人有罪或罪行严重到需要追究刑事责任的程度。

二、申诉到上级检察院的流程与可能性

1. 申诉流程：

   • 如果当事人或其家属对检察机关的不起诉决定不服，可以向上一级检察机关提出申诉。
   • 上一级检察机关在收到申诉后，会进行复查，并根据复查结果作出决定。

2. 公诉的可能性：

   • 证据补充：如果在申诉过程中，发现了新的证据或对原有证据有了新的认识，使得证据变得充分，那么上级检察院有可能决定提起公诉。
   • 证据未变：如果申诉过程中没有发现新的证据，或者新证据仍然不足以支持指控，那么上级检察院通常会维持原不起诉决定。

三、影响公诉决定的因素

1. 证据的充分性：这是决定是否公诉的关键因素。如果证据充分，能够证明犯罪嫌疑人有罪，那么上级检察院很可能会决定公诉。
2. 案件的性质与严重程度：对于性质恶劣、社会影响大的案件，即使证据相对不足，上级检察院也可能更倾向于提起公诉，以维护社会秩序和公平正义。
3. 法律程序与规定：检察机关在决定是否公诉时，必须严格遵守法律程序和规定，确保决定的合法性和正当性。

四、法律建议

1. 积极收集证据：如果当事人或其家属认为证据不足是导致不起诉的主要原因，那么应积极收集新的证据，以支持申诉。
2. 咨询专业律师：在申诉过程中，咨询专业律师的意见是非常重要的。律师可以根据案件的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。
3. 关注案件进展：及时关注案件的进展情况，了解上级检察院的复查结果和决定，以便及时采取相应的法律措施。

进一步思考：在医疗纠纷或侵权损害案件中，证据的收集和保存尤为重要。如果当事人或其家属认为因证据不足导致不起诉是不公正的，那么应积极寻求法律途径来维护自己的权益。同时，也应认识到，法律程序的严格性和公正性是保障社会秩序和公平正义的基础。如果有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。