在工程合同纠纷中，若合同已明确约定计量单位，法院的判决通常会遵循以下核心原则：

1. 优先适用合同约定
   根据《民法典》第510条，合同生效后，当事人就质量、价款等约定不明确的，可协议补充；不能达成补充协议的，按合同相关条款或交易习惯确定。若合同已明确约定计量单位（如“吨”“立方米”“米”等），且该约定不违反法律强制性规定，法院会直接以合同约定作为裁判依据。例如：合同约定钢材按“吨”计量，但施工方主张按“公斤”结算，法院将驳回施工方诉求。

2. 约定存在歧义时的处理
   若合同约定的计量单位存在多种解释（如“批”“套”等模糊表述），法院会结合以下因素综合判断：

   • 合同目的：根据工程性质推断合理计量方式（如混凝土通常按“立方米”而非“吨”计量）；
     
   • 交易习惯：参考行业惯例或当地市场通行做法；
     
   • 双方履约行为：若一方长期按某一方式履行且对方未提出异议，可能视为对约定的变更。
     示例：合同约定“采购一批电缆”，但未明确长度或重量，法院可能根据送货单、验收记录等证据推定实际计量标准。

3. 约定违法或显失公平时的调整
   若合同约定的计量单位明显违反法律（如使用已废止的单位）或导致双方权利义务严重失衡（如约定异常小的单位变相提高价款），法院可能依据《民法典》第151条（显失公平）或第153条（违反法律强制性规定）调整或否定该约定，转而采用法定计量单位或合理标准。

实务建议：

• 签订合同时应明确计量单位（如“钢材：500吨（±5%）”），避免使用模糊表述；
  
• 履约过程中保留送货单、验收单等证据，固定实际计量方式；
  
• 若发现对方未按约定计量，及时提出书面异议并留存沟通记录。
  

如有具体合同条款或纠纷细节，可进一步向我说明，我会结合案例为您详细分析。