在医疗期内，若员工与用人单位协商解除合同，其补偿情况主要依据协商的具体内容以及相关法律法规来确定，一般可能涉及经济补偿金和医疗补助费。以下是对此问题的详细分析：
一、经济补偿金
计算依据：
- 如果协商解除合同是基于用人单位提出，且员工同意，那么根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位通常需要向员工支付经济补偿金。
- 经济补偿金的计算主要依据员工在用人单位的工作年限和解除合同前的月工资。
计算公式：
- 经济补偿金 = 工作年限 × 月工资
- 其中，工作年限每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于所在地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，且最高不超过十二年。
示例：
- 假设员工在用人单位工作了3年7个月，解除合同前12个月的平均工资为5000元，那么经济补偿金为4个月工资，即20000元（5000元×4个月）。
二、医疗补助费
适用情况：
- 医疗补助费主要适用于员工因患病或非因工负伤，在医疗期内被解除合同的情况。虽然协商解除合同可能不直接涉及医疗补助费的支付，但如果员工在医疗期内且病情较重，双方在协商时可能会考虑这一因素。
- 根据原劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》（部分条款虽已废止，但司法实践中仍可能参考）以及部分地区的实际操作，对于患重病和绝症的劳动者，在解除合同时，用人单位可能需要支付额外的医疗补助费。
计算公式（参考）：
- 医疗补助费基础部分：不低于六个月工资。
- 患重病增加部分：不低于医疗补助费基础的百分之五十。
- 患绝症增加部分：不低于医疗补助费基础的百分之百。
- 示例：假设员工月工资是5000元，患重病，那么其应得的医疗补助费至少为6×5000 = 30000元，增加部分为30000×50% = 15000元，总计45000元。
三、协商解除合同的特殊性
- 协商解除合同是双方自愿达成的协议，因此补偿的具体内容和金额可能因情况而异，不一定完全遵循上述标准。
- 在协商过程中，员工应充分了解自己的权益和可能的补偿范围，以便做出合理的决策。
- 如果协商解除合同的条件明显不公平或违反法律法规，员工有权拒绝并寻求法律援助。
四、建议与注意事项
- 了解法律法规：员工在协商解除合同前，应了解相关的法律法规和政策，确保自己的权益不受侵害。
- 收集证据：保留与用人单位的沟通记录、医疗证明等相关证据，以备不时之需。
- 咨询专业意见：如有需要，员工可以向我咨询，以获取更具体的法律建议和帮助。
总结来说，医疗期内协商解除合同的补偿情况因具体情况而异，可能涉及经济补偿金和医疗补助费。员工在协商过程中应充分了解自己的权益和可能的补偿范围，并咨询专业意见以确保自身权益得到充分保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。