房屋的违法与合法认定部门及法院的认定权问题，可以明确以下几点：

1. 认定部门：

   • 通常情况下，房屋的违法与合法性首先由相关的行政管理部门进行认定。例如，城乡规划部门负责认定房屋是否违反了城乡规划法规；住房和城乡建设部门则可能负责认定房屋的建设是否符合建筑规范和安全标准。这些部门在各自的职责范围内，对房屋的合法性进行审查和判断。

2. 法院的认定权：

   • 直接认定：在特定情况下，法院确实有权直接对房屋的违法与合法性进行认定。这通常发生在涉及房屋产权的民事诉讼或行政诉讼中，当行政管理部门已经作出认定，但当事人对该认定存在争议并诉诸法院时，法院会依法对行政行为的合法性进行审查，并在此过程中对房屋的违法与合法性作出独立判断。此外，如果案件事实清楚，且法院认为无需依赖行政管理部门的专业判断，法院也可能直接依据相关法律法规对房屋的合法性进行认定。
   • 间接认定：更多时候，法院在审理涉及房屋产权的案件时，会参考行政管理部门已经作出的认定。这是因为行政管理部门在房屋合法性认定方面具有专业性和权威性，其认定结果通常具有较高的可信度。然而，这并不意味着法院完全受限于行政管理部门的认定，如果法院认为行政认定存在错误或不合理之处，法院仍有权进行独立判断。

3. 法律背景与建议：

   • 法律背景：根据《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规，房屋的建设和使用必须符合城乡规划、建筑规范和安全标准等要求。违反这些要求的房屋，可能被认定为违法建筑，并面临拆除、罚款等法律后果。
   • 法律建议：如果您对房屋的违法与合法性存在疑问，或者面临与房屋产权相关的法律纠纷，建议您首先咨询相关的行政管理部门，了解房屋的具体情况和认定结果。如果行政认定结果存在争议，或者您认为行政认定侵犯了您的合法权益，您可以及时向法院提起诉讼，寻求法律救济。在诉讼过程中，法院将依法对房屋的违法与合法性进行独立判断，并保护您的合法权益。

总结来说，房屋的违法与合法性首先由相关的行政管理部门进行认定，但在特定情况下，法院也有权直接进行认定。如果您对房屋的合法性存在疑问或面临相关法律纠纷，建议您及时咨询专业律师（即我本人，彭文静律师，专注于房产纠纷领域），以便更好地了解您的权利和义务，并寻求有效的法律解决方案。