房屋合法性的认定主要由多个部门依据其职责范围进行，主要包括规划部门、建设部门、不动产登记机构等。以下从不同角度为您详细分析：
规划部门：
- 职责：规划部门负责城市规划的制定和实施，确保建筑物符合城市规划要求。在房屋建设前，开发商或建设单位需要向规划部门申请规划许可证，获得许可后方可进行建设。
- 认定内容：规划部门会审查房屋的建设位置、规模、高度、用途等是否符合城市规划，以及是否占用了公共绿地、道路等公共资源。如果房屋建设违反了规划要求，规划部门有权要求整改或拆除。
建设部门：
- 职责：建设部门负责建筑活动的监督管理，确保建筑物符合建筑安全标准。在房屋建设过程中，建设部门会进行施工许可审批、质量监督、竣工验收等环节。
- 认定内容：建设部门会审查房屋的结构安全、消防安全、环保要求等是否达标。如果房屋存在安全隐患或违反了建筑安全标准，建设部门有权要求停工整改或不予通过竣工验收。
不动产登记机构：
- 职责：不动产登记机构负责不动产权利的登记和发证工作，是房屋合法性的最终确认机构。在房屋建设完成后，开发商或业主需要向不动产登记机构申请房屋所有权登记。
- 认定内容：不动产登记机构会审查房屋的所有权归属、面积、用途等信息是否真实有效，以及是否符合法律法规的规定。如果房屋信息真实有效且符合法律法规，不动产登记机构会颁发房屋所有权证书，确认房屋的合法性。
法律建议：
- 如果您对房屋的合法性有疑问，可以先向当地规划部门、建设部门或不动产登记机构咨询，了解房屋的建设规划、施工许可、竣工验收等情况。
- 如果发现房屋存在违法建设或安全隐患，应及时向相关部门举报，并要求开发商或建设单位进行整改。
- 在购买房屋时，务必要求开发商或卖方提供完整的房屋产权证明和合法建设手续，以确保房屋的合法性和安全性。
可能的法律后果：
- 如果房屋未经规划部门、建设部门或不动产登记机构的合法认定，可能面临被认定为违法建筑的风险，进而被要求拆除或罚款。
- 如果房屋存在安全隐患或违反了建筑安全标准，可能对居住者的生命财产安全造成威胁，同时开发商或建设单位也可能面临法律责任。
如有任何关于房屋合法性的疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。