农村合作建房合同的法律效力需结合具体情形判断，以下是详细分析：

1. 合同效力的一般认定
   若合作建房合同主体适格（如双方具有完全民事行为能力）、意思表示真实（不存在欺诈、胁迫等情形）、内容合法（不违反法律强制性规定或公序良俗），且形式符合要求（如需书面合同），则合同合法有效，对双方具有法律约束力。例如，双方约定共同出资、共同建设、按比例分配房屋，且已实际履行，合同通常有效。

2. 可能影响效力的特殊情形

   • 土地性质问题：若建房用地为集体建设用地（如宅基地），需符合《土地管理法》规定。例如，非本集体经济组织成员参与合作建房，可能因违反“宅基地使用权仅限本集体成员享有”的规定，导致合同部分无效或整体无效。
     
   • 规划许可问题：若未取得乡村建设规划许可证或建设工程规划许可证，合同可能因违反《城乡规划法》而效力存疑，但若后续补办手续，可能补正效力瑕疵。
     
   • 合同目的违法：如以合作建房为名行买卖宅基地之实，合同可能因以合法形式掩盖非法目的而被认定无效。

3. 合同无效后的处理
   若合同被认定无效，双方需根据过错程度返还财产或折价补偿，并可能承担缔约过失责任。例如，若一方明知土地性质违法仍签订合同，需承担主要过错责任。

建议：签订合作建房合同前，务必核实土地性质、规划许可等关键问题，并明确约定双方权利义务（如出资方式、建设标准、房屋分配、违约责任等）。若涉及复杂情形（如跨集体经济组织合作），可进一步向我咨询具体风险防范措施。