关于“乙方加班加点的工资按国家规定的加班工资的计发基数标准计算”这一表述，我们可以从以下几个方面进行详细解读：

一、加班工资计发基数的确定原则

1. 有明确约定的：

   • 如果劳动合同中已经明确规定了加班工资的计发基数，并且这个基数不低于当地的最低工资标准，那么我们就按照这个约定的基数来计算加班工资。例如，若当地月最低工资标准为2000元，而合同中约定加班工资基数为2500元，则加班工资的计算就基于2500元这个基数。

2. 无明确约定的：

   • 如果劳动合同中没有明确约定加班工资的计发基数，那么通常按照劳动者本人正常工作应得的工资来确定，这包括计时工资或计件工资，以及奖金、津贴、补贴等货币性收入（但不包括加班工资本身以及特殊工作环境和条件下的津贴）。在无特别约定的情况下，有的地方可能规定按照正常出勤月工资的70%或其他比例来确定加班工资基数，具体需参照当地的相关规定。

二、不同加班情形的计算标准

1. 工作日加班：

   • 根据《劳动法》第四十四条，工作日延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬。计算公式为：加班工资 = 计算基数÷21.75÷8×加班小时数×150%。

2. 休息日加班：

   • 休息日安排工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。计算公式有两种，以天为单位：加班工资 = 计算基数÷21.75×加班天数×200%；以小时为单位：加班工资 = 计算基数÷21.75÷8×加班小时数×200%。

3. 法定节假日加班：

   • 法定休假日安排工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。计算公式同样有两种，以天为单位：加班工资 = 计算基数÷21.75×加班天数×300%；以小时为单位：加班工资 = 计算基数÷21.75÷8×加班小时数×300%。

三、特殊工资构成的处理

• 对于由多种项目构成的工资，如基本工资、岗位工资、绩效工资等，加班工资基数应主要包含相对固定的部分，如基本工资和岗位工资。而浮动性、不确定性的部分，如绩效工资和奖金，则需根据具体情况判断是否纳入加班工资基数。一般来说，只有固定且持续支付的部分才应计入。

四、实际操作中的注意事项

1. 准确记录加班时间：

   • 用人单位应准确记录乙方的加班时长，无论是工作日延时加班、休息日加班还是法定节假日加班，都应详细记录并作为计算加班工资的依据。

2. 考虑特殊约定与规章制度：

   • 如果劳动合同中有关于加班工资的特别约定，或者公司有相关的规章制度且已经过合法程序制定并公示，这些特殊约定和规章制度也可能影响加班工资的计算。在计算时应予以充分考虑。

3. 遵守法律法规与权益保护：

   • 在计算加班工资时，必须严格遵守国家的相关法律法规，确保乙方的合法权益得到保障。同时，也要注意避免违反劳动法中关于加班时间限制的规定，防止过度加班损害劳动者的身心健康。

五、争议解决途径

• 如果用人单位未按照规定支付加班加点工资，劳动者可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，乙方加班加点的工资计算是一个综合考量多方面因素的过程，需要严格按照法律法规执行，并确保劳动者的合法权益得到有效保护。