工程逾期全额退款是否合法，不能一概而论，需根据具体情况和合同约定来判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同约定角度
合同中有明确约定：
- 如果工程合同中明确约定了工程逾期时，发包方有权要求承包方全额退款，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么该约定是有效的。在这种情况下，工程逾期全额退款是合法的。
合同中没有明确约定：
- 如果合同中没有明确约定工程逾期时的退款责任，那么发包方不能直接要求承包方全额退款。此时，双方应首先通过协商来解决问题，如协商不成，可以依据相关法律法规和合同条款，通过诉讼或仲裁等方式来解决争议。
二、法律法规角度
《民法典》相关规定：
- 根据《民法典》中关于合同违约责任的规定，如果承包方未能按照合同约定的时间完成工程，构成违约，发包方有权要求承包方承担违约责任。但违约责任的具体形式（如赔偿损失、支付违约金等）和金额，应根据合同约定和实际情况来确定，并非一定是全额退款。
其他相关法律法规：
- 除了《民法典》外，还有其他一些与工程建设相关的法律法规，如《建筑法》、《招标投标法》等。这些法律法规主要规范的是工程建设的程序、质量、安全等方面的问题，对于工程逾期时的退款责任并没有直接的规定。因此，在判断工程逾期全额退款是否合法时，主要应依据合同约定和《民法典》的相关规定。
三、实际操作角度
全额退款的合理性：
- 在实际操作中，全额退款往往对承包方来说是一个较为严厉的处罚措施。因此，除非合同中有明确约定或者承包方的违约行为确实给发包方造成了重大损失，否则发包方要求全额退款可能难以得到法院或仲裁机构的支持。
协商与调解：
- 在工程逾期的情况下，双方应首先通过协商来解决问题。如果协商不成，可以考虑通过调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。在这些过程中，双方可以充分陈述自己的理由和证据，由第三方机构来作出公正的裁决。
四、建议与风险提示
完善合同条款：
- 为了避免工程逾期时的退款争议，建议在签订工程合同时，明确约定工程逾期时的违约责任和退款责任。这样可以在发生争议时，有明确的合同依据来解决问题。
及时沟通与协商：
- 在工程建设过程中，双方应保持及时的沟通与协商。如果发现工程可能逾期，应及时通知对方并共同商讨解决方案。这样可以减少争议的发生，并维护双方的合作关系。
寻求法律帮助：
- 如果双方在工程逾期退款问题上无法达成一致意见，建议寻求专业的法律帮助。律师可以根据合同条款和实际情况，为双方提供专业的法律意见和解决方案。
综上所述，工程逾期全额退款是否合法需根据具体情况和合同约定来判断。如果有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。