约定后续以房产抵工程款，这种约定在符合一定条件下是有效的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与有效性条件
合同自由原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权按照自己的意愿设立、变更、终止民事法律关系。因此，双方约定以房产抵工程款，本质上是一种合同行为，只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该约定就是有效的。
物权变动规定：
- 以房产抵工程款，实际上涉及物权的变动。根据《民法典》中关于物权变动的规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。因此，双方约定以房产抵工程款后，还需要办理房产过户登记手续，才能完成物权的变动，使该约定产生对抗第三人的效力。
禁止流押条款：
- 需要注意的是，如果双方在约定中明确，在债务到期不能清偿时，房产直接归债权人所有，这种约定可能因违反禁止流押条款而无效。禁止流押条款是指，抵押权人在债务履行期限届满前，不得与抵押人约定债务人不履行到期债务时抵押财产归债权人所有。这是为了保护债务人的利益，防止债权人利用优势地位获取不当利益。
实际操作中的建议
明确约定内容：
- 双方在约定以房产抵工程款时，应明确约定房产的具体信息（如地址、面积、产权证号等）、抵债金额、过户时间、税费承担等条款，以避免后续产生纠纷。
办理过户手续：
- 双方应尽快办理房产过户登记手续，以确保物权的变动产生法律效力。如果因各种原因无法立即办理过户手续，双方可以签订书面协议，明确过户的时间和条件，并约定违约责任。
考虑税务问题：
- 以房产抵工程款可能涉及税务问题，如契税、个人所得税等。双方在约定时应考虑税务因素，并咨询专业税务人士的意见，以确保合法合规。
可能的法律后果
约定有效且已过户：
- 如果双方约定有效，且已办理房产过户登记手续，那么债权人就取得了房产的所有权，可以依法行使占有、使用、收益和处分的权利。
约定有效但未过户：
- 如果双方约定有效，但未办理房产过户登记手续，那么房产的所有权仍然属于债务人。此时，债权人可以依据约定要求债务人办理过户手续，或者通过法律途径追究债务人的违约责任。
约定无效：
- 如果双方约定因违反法律、行政法规的强制性规定或禁止流押条款而无效，那么债权人不能依据约定取得房产的所有权。此时，双方应恢复原状，即债务人应继续履行支付工程款的义务，债权人应返还已取得的房产（如果已交付）。
总结与建议：约定后续以房产抵工程款在符合一定条件下是有效的。为了确保约定的有效性和避免后续纠纷，双方应明确约定内容、尽快办理过户手续，并考虑税务问题。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。