结论：公司董事指使员工拆除中外合资企业生产流水线设备是否犯法，需根据具体情况判断，可能涉及违法甚至犯罪行为。以下从不同角度进行分析：

1. 从公司法角度分析：

   • 董事的职责与义务：公司董事作为公司管理层，负有忠实和勤勉义务，需维护公司利益，不得损害公司资产。若董事指使员工拆除生产流水线设备，且该行为未经合法程序（如股东会或董事会决议），可能构成对公司财产的侵害，违反董事的忠实和勤勉义务。
   • 公司资产保护：生产流水线设备作为公司的重要资产，其拆除需经过合法程序，并确保公司利益不受损害。若董事未经授权擅自拆除，可能面临公司内部的追责，甚至需承担赔偿责任。

2. 从合同法角度分析：

   • 中外合资企业合同：若中外合资企业合同中明确规定了生产流水线设备的保护、使用或处置方式，董事的行为可能违反合同约定，构成违约。此时，合资他方有权依据合同要求董事承担违约责任。
   • 租赁或融资租赁合同：若生产流水线设备系通过租赁或融资租赁方式取得，董事的行为可能违反租赁合同或融资租赁合同的约定，导致出租方或融资方追究董事的违约责任。

3. 从刑法角度分析：

   • 故意毁坏财物罪：若董事指使员工拆除生产流水线设备，且该行为具有故意性，且拆除行为导致设备价值显著降低或完全毁损，可能构成故意毁坏财物罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百七十五条的规定，故意毁坏公私财物，数额较大或者有其他严重情节的，处三年以下有期徒刑、拘役或者罚金；数额巨大或者有其他特别严重情节的，处三年以上七年以下有期徒刑。
   • 职务侵占罪或贪污罪：若董事利用职务之便，将拆除的设备或设备部件非法占为己有，或转卖牟利，可能构成职务侵占罪（若董事非国家工作人员）或贪污罪（若董事为国家工作人员）。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占罪和贪污罪均可能面临严厉的刑事处罚。

4. 从行政法角度分析：

   • 行政处罚：若董事的行为违反了相关行政法规（如环保法规、安全生产法规等），可能面临行政处罚，如罚款、责令停产整顿等。

法律建议：

• 立即停止行为：若董事已指使员工拆除生产流水线设备，应立即停止该行为，并评估拆除行为对公司、合资他方及第三方造成的损失。
• 内部协商与补救：与公司其他董事、股东及合资他方进行协商，寻求补救措施，如恢复设备原状、赔偿损失等。
• 法律程序：若协商无果，或面临刑事指控，应及时寻求法律帮助，通过法律程序维护自身权益或应对指控。

可能后果：

• 民事责任：董事可能需承担对公司、合资他方及第三方的赔偿责任。
• 刑事责任：若行为构成犯罪，董事可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
• 行政责任：若行为违反行政法规，董事可能面临行政处罚。

如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询，我会结合你的具体情况提供更详细的法律意见。