结论：法院的判决会基于具体的事实和证据，包括员工迟到的情况、单位发放工资的依据以及双方之间的劳动合同或规章制度等。如果单位能证明多发的工资与员工迟到无直接关联，且发放行为存在误解或错误，法院可能会支持单位追回多发的工资；反之，如果单位无法证明，法院可能会维持现状或根据具体情况作出其他判决。
分析说明：
劳动合同与规章制度：
- 首先，要查看员工与单位之间签订的劳动合同以及单位的规章制度。这些文件中通常会规定员工的出勤要求、工资发放方式以及违约责任等。
- 如果劳动合同或规章制度中明确规定了迟到应扣除的工资或相应的处罚措施，并且单位能够证明多发的工资并非基于员工应得的劳动报酬，而是由于误解或错误导致的，那么单位在法律上可能有权追回多发的工资。
单位发放工资的依据：
- 单位发放工资通常基于员工的出勤记录、工作表现以及劳动合同或规章制度的约定。
- 如果单位在发放工资时未能准确记录员工的出勤情况，或者由于疏忽、错误等原因多发了工资，单位需要承担相应的责任。然而，如果单位能够证明多发的工资并非基于员工应得的劳动报酬，而是由于误解或错误，且这种误解或错误并非由员工造成，那么单位在法律上可能有权要求员工返还多发的工资。
法院的判决依据：
- 法院在判决此类案件时，会综合考虑双方提供的证据和事实，包括劳动合同、规章制度、出勤记录、工资发放记录等。
- 如果单位能够提供充分的证据证明多发的工资与员工迟到无直接关联，且发放行为存在误解或错误，法院可能会支持单位追回多发的工资。
- 反之，如果单位无法提供充分的证据，或者员工能够证明多发的工资是其应得的劳动报酬的一部分，法院可能会维持现状或根据具体情况作出其他判决。
行动建议：
对于单位：
- 建议单位加强出勤管理，准确记录员工的出勤情况，避免类似情况的发生。
- 如果发现多发了工资，应及时与员工沟通，并尝试通过协商的方式解决。如果协商无果，可以考虑通过法律途径追回多发的工资，但务必确保有充分的证据支持自己的主张。
对于员工：
- 如果员工确实存在迟到的情况，应主动与单位沟通，了解单位对迟到的处理规定，并尽量避免再次发生。
- 如果单位要求返还多发的工资，员工应仔细审查自己的工资发放记录，确认多发的工资是否确实存在误解或错误。如果认为单位的请求不合理，可以寻求法律帮助来维护自己的权益。
后续思考：
- 在处理此类劳动纠纷时，双方都应保持冷静和理性，通过沟通协商来解决问题。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。
- 单位应加强内部管理，完善规章制度和出勤记录系统，以减少类似纠纷的发生。
- 员工也应增强法律意识，了解自己的权益和义务，以便在发生纠纷时能够更好地维护自己的权益。