在行政诉讼的诉前调解阶段，被告提交的证据在正式立案后通常可以直接使用，其法律依据主要来源于行政诉讼法的相关规定以及司法实践中的一般做法。以下从法律条文和司法实践两个角度进行详细分析：
法律条文角度
证据的提交与审查：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，被告在行政诉讼中有权提交证据以支持其行政行为的合法性。这一权利不仅体现在正式立案后的庭审阶段，也隐含在诉前调解等前期程序中。虽然法律没有直接规定诉前调解阶段提交的证据在正式立案后可以直接使用，但基于证据提交的连续性和诉讼效率的考虑，诉前调解阶段提交的证据在正式立案后通常会被视为已提交的证据进行审查。
证据的效力：
- 证据的效力主要取决于其真实性、合法性和关联性。只要被告在诉前调解阶段提交的证据符合这些要求，且没有因时间推移或其他因素而失去证明力，那么在正式立案后，这些证据仍然具有法律效力，可以被法院采纳。
司法实践角度
诉前调解与庭审的衔接：
- 在司法实践中，诉前调解是行政诉讼程序的一个重要组成部分，旨在通过非诉讼方式解决争议，减轻法院负担，提高诉讼效率。因此，诉前调解阶段提交的证据，如果双方没有异议，且符合证据规则的要求，法院在正式立案后通常会直接采纳，而无需被告再次提交。
证据的重复提交与效率：
- 要求被告在正式立案后再次提交诉前调解阶段已经提交的证据，不仅会增加被告的诉讼成本，也会降低诉讼效率。因此，从司法实践的角度出发，法院通常会允许被告在诉前调解阶段提交的证据在正式立案后直接使用。
注意事项与建议
证据的保存与整理：
- 被告在诉前调解阶段提交证据时，应确保证据的完整性和清晰度，并妥善保存证据原件或复制件。在正式立案后，如果法院需要核对证据原件或要求被告补充相关证据材料，被告应及时提供。
与法院的沟通：
- 在诉前调解阶段，被告可以与法院沟通确认证据的提交方式和效力问题。如果法院有特殊要求或规定，被告应按照法院的要求进行操作，以确保证据的合法性和有效性。
关注证据规则的变化：
- 随着法律的不断完善和司法实践的不断发展，证据规则也可能发生变化。因此，被告在提交证据时，应关注最新的法律动态和司法实践，确保提交的证据符合最新的证据规则要求。
总结来说，在行政诉讼的诉前调解阶段，被告提交的证据在正式立案后通常可以直接使用，但前提是这些证据符合证据规则的要求且没有因时间推移或其他因素而失去证明力。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。