结论：商事仲裁中，若工程主合同约定了仲裁条款，而专业分包合同未约定仲裁，一般情况下，主合同与分包合同不能一起仲裁。但具体能否一起仲裁，还需根据合同的具体内容、仲裁条款的约定以及案件的具体情况来综合判断。
分析说明：
合同相对性原则：
- 仲裁条款通常具有相对性，即它只约束签订该条款的合同双方。在工程主合同中约定了仲裁条款，意味着主合同的双方同意将争议提交仲裁解决。
- 专业分包合同是另一个独立的合同，如果分包合同中没有约定仲裁条款，那么分包合同的双方就没有达成将争议提交仲裁的合意。
仲裁条款的独立性：
- 仲裁条款通常被视为合同中的一个独立部分，即使合同的其他部分无效或被撤销，仲裁条款仍然有效。但这并不意味着一个合同的仲裁条款可以自动适用于另一个没有仲裁条款的合同。
可能的例外情况：
- 如果主合同和分包合同之间存在某种关联，且仲裁条款的约定足够宽泛，有可能被解释为涵盖分包合同的争议。但这种情况较为罕见，且需要具体的合同文本和案件事实来支持。
- 另一种可能是，如果分包合同中的争议实际上与主合同紧密相关，且双方同意将争议一并提交仲裁，那么可以通过补充协议或其他方式明确这一点。
法律建议：
审查合同文本：
- 仔细审查工程主合同和专业分包合同的文本，特别是仲裁条款的约定。确定仲裁条款的具体内容、适用范围以及是否涉及分包合同。
咨询专业意见：
- 如果对合同文本的理解存在疑问，或者不确定仲裁条款是否适用于分包合同，建议咨询专业的法律人士，如律师或仲裁员，以获取准确的法律意见。
考虑补充协议：
- 如果双方希望将分包合同的争议也提交仲裁解决，可以考虑签订补充协议，明确约定分包合同的争议也适用主合同中的仲裁条款。
准备替代方案：
- 如果无法将分包合同的争议提交仲裁解决，双方应准备替代的争议解决方式，如诉讼或调解等。
后续行动：
- 在处理此类问题时，建议首先与对方进行沟通，明确双方对争议解决方式的期望和态度。
- 如果沟通无果，或者对方坚持不同的争议解决方式，那么应根据合同文本和法律规定，准备相应的法律文件和证据，以维护自己的合法权益。
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