结论：若工程分包合同中明确约定了仲裁条款，一般情况下，当事人应当通过仲裁解决争议，而不能直接向法院起诉。但存在例外情形，如仲裁协议无效等，此时当事人可以向法院起诉。

详细分析：

1. 仲裁协议的效力：

   • 根据《中华人民共和国仲裁法》第五条：“当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。” 这表明，如果合同中存在有效的仲裁协议，当事人应当通过仲裁方式解决争议，法院将不会受理此类案件。

2. 仲裁协议无效的情形：

   • 尽管合同中约定了仲裁条款，但如果该仲裁协议存在无效情形，如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议、一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议等，那么该仲裁协议将无效。在此情况下，当事人可以向法院起诉。
   • 具体来说，根据《中华人民共和国仲裁法》第十七条：“有下列情形之一的，仲裁协议无效：（一）约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的；（二）无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议；（三）一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。”

3. 仲裁与诉讼的选择：

   • 在合同中明确约定仲裁条款的情况下，当事人应当优先选择仲裁方式解决争议。仲裁具有专业性、高效性、保密性等优点，能够更好地满足当事人的需求。
   • 如果当事人对仲裁结果不满意，且符合法律规定的条件，还可以在特定情况下向法院申请撤销仲裁裁决或不予执行仲裁裁决。但这并不意味着当事人可以直接绕过仲裁程序向法院起诉。

4. 实际操作建议：

   • 在签订工程分包合同时，当事人应当仔细审查合同中的争议解决条款，确保仲裁协议的合法性和有效性。
   • 如果合同中确实存在仲裁条款，且当事人希望解决争议，应当按照合同约定向约定的仲裁机构申请仲裁。
   • 如果当事人认为仲裁协议存在无效情形，或者希望直接通过诉讼方式解决争议，应当及时咨询专业律师，评估法律风险和可行性，并采取相应的法律措施。

总结与启示： 工程分包合同中明确约定仲裁条款的情况下，当事人应当遵循合同约定，通过仲裁方式解决争议。但同时，当事人也应当了解仲裁协议无效的情形，以便在必要时采取相应的法律措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。