结论：工程预付款被查封后，您有权提出执行异议，但能否成功需视具体情况而定。以下从多个角度为您详细分析：
一、执行异议的法律依据
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，当您认为执行行为违反法律规定，或者对执行标的（如工程预付款）享有足以排除强制执行的权益时，可以向执行法院提出书面异议。这是您提出执行异议的法律依据。
二、提出执行异议的情形
对执行行为的异议：
- 如果您认为执行法院在查封工程预付款的过程中存在程序违法、超标的查封等情形，可以提出执行行为异议。
- 例如，执行法院未按照法定程序进行查封，或者查封的金额超过了您应支付的款项等。
对执行标的的异议：
- 如果您认为工程预付款属于您所有，或者您对该款项享有优先受偿权等足以排除强制执行的权益，可以提出执行标的异议。
- 例如，工程预付款是您按照合同约定预先支付给施工方的，且该款项尚未被施工方用于工程支出，或者您根据法律规定或合同约定对该款项享有优先受偿权。
三、提出执行异议的程序
提交书面异议：
- 您需要向执行法院提交书面异议申请，明确说明异议的理由和依据。
- 异议申请应当包括您的基本信息、执行案件的基本情况、异议的具体内容和理由等。
法院审查：
- 执行法院会对您的异议申请进行审查，并根据审查结果作出裁定。
- 如果法院认为您的异议成立，可能会裁定中止对该款项的执行；如果认为异议不成立，则会裁定驳回。
后续救济：
- 如果您对执行法院的裁定不服，可以在法定期限内向上一级法院申请复议或者提起执行异议之诉。
四、提出执行异议的注意事项
及时提出：
- 您应当在知道或者应当知道执行行为或执行标的侵害您的权益之日起法定期限内提出异议，以免丧失救济机会。
充分准备证据：
- 在提出异议时，您需要提供充分的证据来支持您的主张，如合同、付款凭证、优先受偿权证明等。
寻求专业帮助：
- 由于执行异议涉及复杂的法律程序和实体问题，建议您在提出异议前咨询专业律师，以确保您的权益得到充分保障。
五、可能面临的法律后果
异议成立：
- 如果您的异议成立，执行法院可能会裁定中止对该款项的执行，这将为您争取到更多的时间和空间来处理相关问题。
异议不成立：
- 如果您的异议不成立，执行法院将继续执行该款项，您可能需要承担相应的法律后果，如支付款项、承担执行费用等。
建议：针对您提出的工程预付款被查封能否提执行异议的问题，我建议您首先评估自己对该款项是否享有足以排除强制执行的权益，并收集相关证据。然后，及时向执行法院提交书面异议申请，并按照法院的要求参与后续程序。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供进一步的法律建议。