结论：即使已在解除劳动合同的协议上签字，劳动者在符合法定条件下依然有权申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。以下是对这一结论的详细分析：

一、可以申请劳动仲裁的情形

1. 协议存在瑕疵

   • 重大误解或显失公平：若劳动者在签订协议时对重要内容有重大误解，或协议内容对劳动者明显不公平，导致权利义务失衡，劳动者可在知道或应当知道撤销事由之日起一年内申请仲裁，请求撤销协议并主张实际权益。例如，劳动者可能对经济补偿的计算方式存在误解，或者协议中约定的补偿金额远低于法定标准。
   • 欺诈、胁迫或乘人之危：如用人单位通过欺诈、胁迫或利用劳动者困境迫使其签订协议，劳动者有权在法定时效内申请仲裁，维护自身权益。例如，用人单位可能以不签协议就不发工资为威胁，迫使劳动者签订不公平的协议。

2. 协议内容违法

   • 若协议条款违反劳动法律法规的强制性规定，如约定不缴纳社保、不支付加班费等，这些条款无效。劳动者可就无效条款涉及的权益问题申请仲裁，要求用人单位按照法律规定履行义务。

3. 用人单位未履行协议

   • 如用人单位未按协议约定履行义务，如未支付经济补偿、未办理离职手续等，劳动者可通过仲裁要求其履行并支付相应款项。

4. 其他劳动争议

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同发生的争议，以及涉及工作时间、休息休假、社会保险、福利等劳动争议，只要在仲裁时效期间内，均可申请仲裁。

二、可能无法申请仲裁或仲裁请求难以得到支持的情形

1. 协议合法有效且已履行完毕

   • 若协议是双方真实意思表示，内容合法，无欺诈、胁迫等可撤销情形，并已按约定履行完毕，劳动者再申请仲裁，仲裁机构可能会驳回请求。因为此时双方的权利义务已经得到了妥善的处理，不存在争议。

2. 超出仲裁时效

   • 劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。若劳动者自权利被侵害之日起超过一年才申请仲裁，且无时效中断、中止的法定情形，仲裁机构可能以超出时效为由驳回申请。因此，劳动者在发现权益受到侵害后，应及时申请仲裁，以免错过时效。

三、申请劳动仲裁的流程与注意事项

1. 准备证据材料

   • 劳动者在申请仲裁时，需准备充分的证据材料支持其仲裁请求，包括但不限于劳动合同、工资单、解雇通知、沟通记录等。这些证据将有助于仲裁机构了解案件事实，作出公正裁决。

2. 提交书面仲裁申请

   • 劳动者应向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，并按照要求填写相关信息。申请中应明确仲裁请求、事实和理由等关键内容。

3. 参与仲裁程序

   • 在仲裁过程中，劳动者应积极参与调解和开庭审理等环节，如实陈述事实，提供证据材料，并遵守仲裁机构的纪律和规定。

4. 接收裁决书并根据需要采取后续行动

   • 仲裁机构将依法对申请进行审理，并根据事实和法律作出公正的裁决。劳动者在接收裁决书后，应根据裁决结果采取相应的后续行动，如履行义务、申请强制执行或提起诉讼等。

建议：在签订解除劳动合同协议前，劳动者应充分了解协议内容，确保自己的权益不受侵害。如有必要，可寻求专业法律意见，以避免不必要的纠纷。同时，在发现权益受到侵害后，应及时申请仲裁，以免错过时效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。