员工旷工两天不发当月工资是违法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律条款依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：明确规定“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这表明，无论劳动者是否存在旷工行为，用人单位都无权克扣其已提供劳动部分的工资。旷工两天属于未提供部分劳动，但已提供劳动的部分对应的工资，用人单位必须支付。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条第一款：规定“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”这进一步强调了用人单位支付工资的义务和责任，旷工不能成为不支付当月工资的合法理由。
- 《工资支付暂行规定》第十五条：列举了用人单位可以代扣劳动者工资的情形，如代扣个人所得税、社会保险费用等，但并未包括因旷工而扣除当月工资的情况。同时，该规定第十六条指出：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”这意味着，即使劳动者旷工给用人单位造成损失，用人单位也只能在合理范围内扣除其当月工资，且需遵循法定程序和标准，而不是直接不发当月工资。
工资支付与旷工行为的独立性
工资是劳动者基于其提供的劳动而应得的报酬，与劳动者是否旷工无直接关联。旷工行为应依据公司规章制度进行相应处理，如警告、罚款（需在合法范围内）、解除劳动合同等，但不能作为不支付当月工资的理由。例如，公司可以在规章制度中规定旷工一天扣除一定比例的绩效工资，但不能规定旷工两天就不发当月全部工资。
用人单位的义务
用人单位有义务按时足额支付劳动者工资，这是其法定义务。若因劳动者旷工而拒绝支付当月工资，不仅违反了法律规定，也损害了劳动者的合法权益。劳动者有权依据相关法律法规维护自己的权益。
法律后果
若用人单位因劳动者旷工两天而不发当月工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付被克扣的工资及相应的经济补偿金。根据《劳动保障监察条例》第二十六条，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资报酬的，由劳动保障行政部门分别责令限期支付劳动者的工资报酬；逾期不支付的，责令用人单位按照应付金额50％以上1倍以下的标准计算，向劳动者加付赔偿金。
建议措施
- 劳动者：在遇到此类情况时，应保留好相关证据（如工资条、考勤记录、工作证等），及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 用人单位：应严格遵守法律法规，按时足额支付劳动者工资。对于劳动者的旷工行为，应按照公司规章制度进行相应处理，但不得以此为由克扣或拖欠工资。
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