旷工一天扣除两天工资是违法的。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，除非有法定事由或双方约定的事由，否则用人单位不能随意扣除劳动者的工资。
   • 《工资支付暂行规定》第十六条也规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。

2. 对“旷工一天扣两天工资”的分析：

   • 这种做法违反了《劳动法》关于不得克扣或无故拖欠劳动者工资的规定。旷工一天，劳动者仅当天未提供劳动，因此用人单位最多只能不支付当天的工资，而不能额外扣除其他天数的工资。
   • 即使劳动者旷工给用人单位造成了经济损失，用人单位也需要按照法律规定的程序和要求进行赔偿，而不能直接以扣两天工资的方式进行处理。

3. 建议与措施：

   • 用人单位应确保规章制度的内容合法且合理，避免设置过高的罚款数额。对于旷工等违纪行为，应依据合法有效的规章制度进行处理，并确保处理程序的合法性。
   • 劳动者在面对不合理的扣款时，有权与用人单位进行沟通协商，并可以寻求专业的法律咨询以维护自己的合法权益。

综上所述，旷工一天扣除两天工资是违法的。用人单位在处理员工旷工问题时，应遵守相关法律法规，确保处理方式的合法性和合理性。劳动者也应了解自己的权益，面对不合理扣款时及时维权。