员工发生二级工伤后提出离职，公司是需要进行赔偿的。以下从不同角度为你详细分析：
法律依据与赔偿项目
根据《工伤保险条例》及相关规定，员工因工致残被鉴定为二级伤残的，保留劳动关系，退出工作岗位，享受以下待遇：
一次性伤残补助金：
- 计算公式：一次性伤残补助金 = 本人工资 × 25个月
- 说明：本人工资是指工伤职工因工作遭受事故伤害或者患职业病前12个月平均月缴费工资。本人工资高于统筹地区职工平均工资300%的，按照统筹地区职工平均工资的300%计算；本人工资低于统筹地区职工平均工资60%的，按照统筹地区职工平均工资的60%计算。
伤残津贴：
- 计算公式：伤残津贴 = 本人工资 × 85%
- 说明：伤残津贴实际金额低于当地最低工资标准的，由工伤保险基金补足差额。并且，伤残津贴由工伤保险基金按月支付，直至员工达到退休年龄并办理退休手续后，停发伤残津贴，按照国家有关规定享受基本养老保险待遇。
离职后的额外补偿：
- 若员工在享受上述待遇后提出离职，虽然一次性伤残补助金和按月领取的伤残津贴是基于保留劳动关系的前提，但员工离职时，公司通常还需支付一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金（具体标准可能因地区而异，需参照当地规定）。不过，对于二级伤残这种严重情况，很多地方可能规定不得解除或终止劳动关系，除非员工本人提出，且即便提出，也可能不享受一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金，或者享受的标准有特别规定。但无论如何，员工因工伤导致的医疗费用、康复费用等，在离职后仍可按工伤保险规定报销。
实际操作中的注意事项
协商与沟通：
- 在员工提出离职前，公司应与员工进行充分沟通，了解其离职的真实原因和意愿，尽量协商解决，避免法律纠纷。
遵循法定程序：
- 如果员工坚持离职，公司应确保按照法定程序办理离职手续，包括支付应得的赔偿和福利，以及办理社保关系的转移等。
关注地方性规定：
- 由于工伤保险待遇的具体标准可能因地区而异，公司在处理此类问题时，应密切关注当地的相关规定和政策，确保合规操作。
可能的法律后果
- 如果公司未按照法律规定支付赔偿或福利，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付应得的赔偿和福利。
- 如果公司违反法律规定解除或终止与员工的劳动关系，还可能面临支付赔偿金等法律责任。
总结与建议：员工发生二级工伤后提出离职，公司是需要进行赔偿的，具体赔偿项目和标准需根据《工伤保险条例》及当地相关规定确定。建议公司在处理此类问题时，务必遵循法律规定，与员工进行充分沟通，确保合规操作，避免法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。