结论：在房屋租赁合同中约定“租金不含税，税金由租户承担”是合法的，但前提是这一约定必须基于双方自愿、平等协商，且不违反法律法规的强制性规定。同时，合同条款应明确具体，确保税金的种类、计算方式等内容清晰无歧义。
法律分析
意思自治原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动应当遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。在房屋租赁中，出租方和承租方作为平等的民事主体，有权通过合同约定税金的承担方式。只要该约定是基于双方的自愿和平等协商达成的，且不违反法律的强制性规定，即应受到法律保护。
纳税义务人与税负承担的区分：
- 税收法律法规中明确规定了出租房屋的各项税金纳税义务人通常是出租方，如增值税、房产税等。然而，这并不妨碍双方在租赁合同中约定由承租方实际承担这些税金。纳税义务人的确定是从税收征管的角度出发，而合同约定的税负承担则是民事主体之间对于经济利益分配的安排。只要税金最终依法足额缴纳，合同的税负承担条款即具有法律效力。
合同条款的明确性：
- 为避免日后产生争议，租赁合同中的税金条款应明确、具体地约定税金的种类、计算方式、缴纳时间等内容。这样不仅可以确保双方对税金的承担有清晰的了解，还能在发生纠纷时提供明确的法律依据。
实际操作中的注意事项
合同条款的明确性：
- 在签订租赁合同时，双方应充分协商并明确税金的承担方式。合同中应详细列明税金的种类（如增值税、房产税、个人所得税等）、计算方式（如按租金比例计算、固定金额等）以及缴纳时间等关键信息。
税务合规性：
- 无论合同如何约定税金的承担方式，出租方作为纳税义务人仍需依法履行纳税义务。承租方在承担税金时，应确保税金已依法缴纳，并保留好相关的缴税凭证和发票。
纠纷解决机制：
- 如因税金承担问题发生纠纷，双方应首先尝试通过协商解决。协商不成时，可寻求法律援助或向法院提起诉讼以维护自己的合法权益。在诉讼过程中，法院将根据合同约定、法律法规以及实际情况来综合判断税金的承担方式。
可能的法律后果
如果合同约定合法有效：
- 如果租赁合同中的税金承担条款合法有效，且双方已按照约定履行了各自的义务，那么一般不会产生法律纠纷。即使发生纠纷，法院也会根据合同约定来判决税金的承担方式。
如果合同约定违法或无效：
- 如果租赁合同中的税金承担条款违反了法律法规的强制性规定或存在欺诈、胁迫等情形导致合同无效，那么出租方仍需依法承担纳税义务。同时，承租方可能因未依法缴纳税金而面临税务部门的追缴和处罚。
建议：在签订租赁合同时，双方应充分协商并明确税金的承担方式，确保合同条款的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。