结论：行政机关在法院判决应出具信访答复意见的情况下，仍然出具行政答复意见，这一行为是否违法，需结合具体情况判断，若行政答复意见未实质回应信访诉求，或未遵循信访程序，则可能构成违法；若行政答复意见实质回应了信访诉求，且程序合法，则不一定违法。以下从不同角度详细分析：
一、信访答复意见与行政答复意见的区别
- 信访答复意见：通常针对信访人的诉求，由有权处理的行政机关或相关部门进行调查核实后，按照信访程序作出的答复。它更侧重于对信访事项的直接回应和解决。
- 行政答复意见：则是行政机关在行使行政职权过程中，对特定事项作出的具有行政效力的答复。它可能涉及行政许可、行政处罚、行政确认等多种行政行为。
二、行政机关行为的合法性分析
若行政答复意见未实质回应信访诉求：
- 在这种情况下，行政机关的行为可能违反了信访程序的相关规定。信访程序要求行政机关对信访人的诉求进行认真调查核实，并给出实质性的答复。如果行政机关只是出具了一份与信访诉求无关或未实质回应的行政答复意见，那么这一行为可能构成违法。
若行政答复意见未遵循信访程序：
- 信访程序有其特定的流程和要求，包括受理、调查、答复等环节。如果行政机关在出具行政答复意见时，未遵循这些程序要求，如未进行充分的调查核实、未在规定期限内答复等，那么这一行为也可能构成违法。
若行政答复意见实质回应了信访诉求，且程序合法：
- 在这种情况下，行政机关的行为可能并不违法。虽然法院判决应出具信访答复意见，但如果行政机关通过行政答复意见实质回应了信访诉求，并且这一答复意见在程序上也是合法的，那么可以认为行政机关已经履行了其职责。然而，这并不意味着行政机关可以随意以行政答复意见替代信访答复意见，因为两者在性质和目的上存在差异。
三、法律建议
对于信访人：
- 如果认为行政机关的行为违法，可以向上一级行政机关或相关部门提出申诉或举报，要求其进行调查处理。
- 同时，也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如提起行政诉讼或申请行政复议。
对于行政机关：
- 应严格遵守信访程序的相关规定，对信访人的诉求进行认真调查核实，并给出实质性的答复。
- 在出具答复意见时，应明确区分信访答复意见和行政答复意见，避免混淆使用。
四、可能的法律后果
如果行政机关的行为被认定为违法：
- 可能会面临上级行政机关的责令改正、通报批评等行政处分。
- 如果给信访人造成了损失，还可能需要承担相应的赔偿责任。
如果行政机关的行为被认定为合法：
- 则不需要承担上述法律后果，但应继续加强信访工作，提高信访事项的处理效率和质量。
最后，行政机关在法院判决应出具信访答复意见的情况下，仍然出具行政答复意见是否违法，需结合具体情况判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。