结论前置：姐姐将房屋过户给弟弟的赠与协议，在弟弟未来出售该房屋时，确实可能会面临一些额外的麻烦和税费成本，但具体影响取决于房屋持有时间、当地政策以及出售时的市场情况等多种因素。以下从几个关键角度详细分析：

一、赠与过户后的税费成本

1. 契税：弟弟作为受赠人，在接受赠与时需要缴纳房屋评估价值的3%作为契税（部分地区可能有减免政策，需具体查询当地规定）。

2. 个人所得税：如果弟弟在未来出售该房屋，且该房屋并非其唯一住房或未满足“满五唯一”的条件（即自用五年以上并且是家庭唯一生活用房），则可能需要缴纳高额的个人所得税。根据税法规定，个人所得税通常按房屋出售价格与受赠时价格的差额的20%计征，或者按出售价格的1%-3%计征（具体税率和计算方式可能因地区而异）。

   • 计算公式示例（假设按差额20%计征）：
     • 应纳税所得额 = 出售价格 - 受赠时价格 - 相关税费
     • 个人所得税 = 应纳税所得额 × 20%

二、赠与过户后的限售政策

部分城市对赠与后房屋的限售年限有严格规定，例如取得产权证后2年内不得上市交易。如果弟弟在限售期内出售房屋，可能会面临无法过户或需要缴纳额外税费的风险。因此，在出售前务必了解并遵守当地的限售政策。

三、赠与过户与买卖过户的对比

1. 赠与过户：

   • 优点：流程相对简单，耗时较短；契税成本相对较低（但需注意未来出售时的个人所得税成本）。
   • 缺点：未来出售时可能面临高额个人所得税和限售政策限制。

2. 买卖过户：

   • 优点：未来出售时税费成本相对较低（尤其是满足“满五唯一”条件时）；不受限售政策限制（除非当地有特殊规定）。
   • 缺点：流程繁琐且周期长；契税、增值税及附加税、个人所得税等总成本可能因房屋具体情况而波动，通常高于赠与方式（但需考虑未来出售时的税费节省）。

四、法律建议

1. 了解当地政策：在决定过户方式前，务必了解并咨询当地房管局或税务局关于赠与过户和买卖过户的具体政策、税费标准和限售规定。

2. 综合考虑成本：根据房屋的具体情况（如持有时间、未来出售计划等）和当地政策，综合考虑赠与过户和买卖过户的总成本（包括当前过户成本和未来出售成本）。

3. 咨询专业人士：如果对过户方式或税费计算有疑问，建议咨询专业的房地产律师或税务师，以确保决策的科学性和合法性。

总结：姐姐将房屋过户给弟弟的赠与协议，在弟弟未来出售该房屋时可能会面临一些额外的麻烦和税费成本。因此，在决定过户方式前，务必充分了解当地政策、综合考虑成本，并咨询专业人士的意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。