公司股东指使门店经理删除员工工资信息，这一行为可能涉及多个罪名，具体取决于行为的性质、目的以及造成的后果。以下是一些可能的罪名分析：
破坏计算机信息系统罪：
- 如果删除员工工资信息的行为是通过破坏计算机信息系统（如篡改、删除系统内的数据）来实现的，且造成了系统不能正常运行，后果严重的，那么根据《中华人民共和国刑法》第二百八十六条，可能构成破坏计算机信息系统罪。这一罪名要求行为具有破坏性，且后果达到一定的严重程度。
侵犯公民个人信息罪（若涉及非法获取或泄露）：
- 虽然直接删除信息本身不直接构成此罪，但如果删除行为伴随着非法获取、出售或提供员工工资信息等行为，且情节严重的，可能构成侵犯公民个人信息罪。不过，就本问题描述而言，此罪名可能不是最直接相关的，除非有额外证据表明存在非法获取或泄露行为。
职务侵占罪或贪污罪（若涉及非法占有公司财产）：
- 如果删除工资信息的目的是为了掩盖非法占有公司财产（如虚报工资、贪污等）的行为，且数额较大，那么根据具体情况，可能构成职务侵占罪（针对非国家工作人员）或贪污罪（针对国家工作人员）。但这一罪名成立的前提是存在非法占有的行为，而不仅仅是删除信息。
妨害作证罪或帮助毁灭、伪造证据罪（若涉及诉讼或仲裁）：
- 如果删除工资信息的行为发生在诉讼或仲裁过程中，且目的是为了妨害对方当事人收集证据或帮助当事人毁灭、伪造证据，那么根据《中华人民共和国刑法》第三百零七条，可能构成妨害作证罪或帮助毁灭、伪造证据罪。这一罪名要求行为发生在特定的法律程序中，且具有妨害诉讼或仲裁的目的。
在大多数情况下，公司股东指使门店经理删除员工工资信息，更可能的是一种违法行为，但不一定直接构成犯罪。它可能违反了公司的内部规章制度，或者侵犯了员工的知情权等合法权益。如果这种行为没有造成严重的后果，或者没有触犯上述具体的罪名，那么可能只会受到行政处罚或民事赔偿的制裁。
法律建议：
- 对于公司股东和门店经理而言，应严格遵守法律法规和公司规章制度，不得擅自删除或篡改员工工资信息等重要数据。
- 如果员工发现自己的工资信息被非法删除或篡改，应及时向公司反映情况，并保留相关证据以便后续维权。
- 在必要时，可以寻求法律援助或向相关部门投诉举报，以维护自己的合法权益。
若你面临类似情况或有进一步的法律疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供更详细、更专业的法律建议。