结论：公司辞退员工时，工资的发放与计算需分情况讨论。正常工作期间的工资应确保按时足额支付，该工资为实发工资；而涉及经济补偿金等赔偿计算时，通常应以应发工资为基数。
一、正常工作期间的工资支付
根据《劳动合同法》及相关法律法规，员工被单位辞退时，单位应在解除劳动关系后的法定支付周期内，按时足额支付员工在被辞退前按照劳动合同约定的工资标准和工作天数应获得的工资，即实发工资。这是为了确保劳动关系的真正解除，避免后续纠纷。
实例说明：假设员工小李月应发工资为8000元，扣除社保、公积金个人部分及个人所得税后实发工资为6500元。若公司正常辞退小李，需支付其当月实际工作天数的工资，该工资为实发工资，即按照6500元的标准进行折算支付。
二、经济补偿金的计算基础
若因公司原因违法辞退员工，员工除可获得正常工资外，还有权获得经济补偿金。经济补偿金的计算标准通常为员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
关于经济补偿金中月工资的计算基础，《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条明确规定，劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。这是因为应发工资更能全面、真实地反映劳动者的劳动价值和收入水平。
计算公式： 经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（应发工资）
实例说明：继续以小李为例，若其月应发工资为8000元，在公司工作了3年，后被公司违法辞退。那么，小李应获得的经济补偿金为：3年 × 8000元/年 = 24000元。
三、特殊情况下的工资与补偿
高薪员工：如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么向其支付经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额来支付，且支付年限最高不超过十二年。
违法解除合同：若用人单位违反规定解除或终止劳动合同，则需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
四、操作建议与权益保障
明确约定：为避免后续纠纷，建议用人单位和劳动者在劳动合同中明确约定经济补偿金的计算方式。
及时足额支付：用人单位在辞退员工时，应确保工资的及时、足额发放，并依法支付经济补偿金（如适用），以维护劳动者的合法权益。
维权途径：如果单位未按时足额支付工资或经济补偿金，员工有权向劳动监察大队投诉维权，或申请劳动仲裁。
综上所述，公司辞退员工时，工资的发放与计算需根据具体情况进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。