在母亲在世的情况下，父亲去世后留下的50万存款，原则上属于父母的夫妻共同财产，需先分割出母亲的一半份额，剩余部分才作为父亲的遗产由五个子女和母亲共同继承。具体分析如下：

1. 财产性质认定：

   • 根据《民法典》第1062条，婚姻关系存续期间取得的财产原则上属于夫妻共同财产。若50万存款是父母婚姻存续期间积累的，则其中25万属于母亲个人财产，剩余25万才是父亲遗产。
   • 特殊情形：若能证明存款中有父亲婚前个人财产（如婚前存款、明确赠与父亲个人的财产等），则该部分不纳入遗产范围。

2. 继承权分配：

   • 法定继承顺序：根据《民法典》第1127条，第一顺序继承人为配偶、子女、父母。本案中父亲父母若已去世，则继承人为母亲和五个子女共6人。
   • 遗产分割原则：25万遗产由6人平分，每人约4.17万元。母亲最终可获得25万（个人财产）+4.17万（继承份额）=29.17万元，五个子女各继承4.17万元。

3. 实务操作建议：

   • 协商优先：建议家庭成员通过协商确定分配方案，可签订书面协议明确各自份额，避免后续纠纷。
   • 公证继承：若协商一致，可共同到公证处办理继承权公证，凭公证书办理存款支取或过户手续。
   • 诉讼解决：若协商不成，任何继承人可向法院提起继承纠纷诉讼，由法院判决分配方案。

4. 注意事项：

   • 保留证据：需提供存款凭证、父母婚姻关系证明、亲属关系证明等材料。
   • 特殊情形处理：若存在遗嘱、遗赠扶养协议或丧失继承权情形（如故意杀害被继承人），需按特别规定处理。
   • 税务问题：目前继承环节暂不征收个人所得税，但若后续转让财产可能涉及税费。

温馨提示：家庭财产分配涉及情感与法律双重考量，建议处理时兼顾公平与亲情维护。如有复杂情况（如财产来源争议、继承人能力差异等），可进一步向我说明细节，我会为您提供针对性方案。