结论：销售合同中结款方式可以写按照双方协议执行，但需确保协议内容明确、合法且具备可操作性，以避免潜在纠纷。以下从不同角度详细分析：

1. 合同自由原则下的合法性

根据《中华人民共和国民法典》第四百七十条，合同内容由当事人约定，一般包括价款或报酬、履行期限等条款。结款方式作为价款支付的核心条款，双方可自由约定（如分期支付、一次性支付、第三方托管等）。若约定“按双方协议执行”，需满足以下条件：

• 协议独立性：该“协议”需是合同附件或补充协议，明确支付时间、方式、条件等细节，避免因条款模糊导致争议。
• 合法性：协议内容不得违反法律强制性规定（如禁止高利贷、洗钱条款等），否则可能被认定无效。
• 可操作性：协议需具备实际履行可能性（如约定“以甲方收到乙方货物后30日内付款”需明确验收标准）。

示例：若合同主文约定“结款方式按双方协议执行”，同时附《支付协议》明确“乙方交付货物后，甲方需在5个工作日内通过银行转账支付全款”，则该条款合法有效。

2. 潜在风险与防范

若仅笼统约定“按双方协议执行”而未附具体协议，可能引发以下风险：

• 条款模糊风险：双方对“协议”内容产生分歧（如一方认为协议是口头约定，另一方认为是书面补充协议），导致付款义务履行争议。
• 举证困难风险：若协议未以书面形式固定，发生纠纷时可能因证据不足而败诉。
• 格式条款风险：若合同为格式条款，且“按双方协议执行”未以显著方式提示对方注意，可能被认定为无效条款。

建议：

• 书面化：将结款方式的具体内容（如支付时间、方式、违约责任）写入合同或作为附件，避免口头约定。
• 明确化：使用具体条款替代模糊表述，例如：“甲方应于收到乙方开具的合法发票后10个工作日内，通过银行转账支付至乙方指定账户”。
• 公证或见证：对重要协议进行公证或第三方见证，增强证据效力。

3. 实务操作中的灵活性

在商业实践中，结款方式常需根据交易特点调整，以下情形可参考：

• 长期合作：可约定“按双方年度结算协议执行”，并明确年度结算周期、对账方式等。
• 分期付款：可约定“按《分期支付协议》执行”，并附分期时间表及每期金额。
• 第三方支付：可约定“通过XX平台托管资金，按平台规则释放款项”，需确保平台合规性。

总结：销售合同中结款方式可写“按双方协议执行”，但需以书面形式明确协议内容，确保合法、具体且可操作。若您需进一步设计合同条款或处理纠纷，可直接向我咨询，我将结合具体交易场景提供专业建议。