变相扣工资是可以申请劳动仲裁的。以下从多个角度为你详细分析：
法律背景
根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果用人单位存在变相扣工资的行为，即未按照劳动合同约定或国家规定支付劳动报酬，那么劳动者的合法权益就受到了侵害。
劳动仲裁的适用性
劳动仲裁是解决劳动争议的一种重要方式，它适用于用人单位与劳动者之间因劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等事项发生的争议。变相扣工资显然属于劳动报酬方面的争议，因此完全符合劳动仲裁的受理范围。
具体情形分析
变相扣工资的形式：
- 用人单位可能以各种名义，如“罚款”、“扣款”、“绩效调整”等，变相减少劳动者的工资。
- 这些行为如果未经劳动者同意，或者没有合理的依据，就可能构成变相扣工资。
劳动仲裁的申请条件：
- 劳动者需要与用人单位存在劳动关系。
- 劳动者需要提供证据证明用人单位存在变相扣工资的行为，如工资条、银行转账记录、劳动合同等。
- 劳动者需要在知道或应当知道其权益被侵害之日起一年内申请劳动仲裁。
劳动仲裁的流程：
- 劳动者向当地劳动仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据材料。
- 劳动仲裁委员会在收到申请后，会进行审查并决定是否受理。
- 如果受理，劳动仲裁委员会会安排开庭审理，并作出裁决。
法律建议
- 保留证据：如果你发现用人单位存在变相扣工资的行为，一定要及时保留相关证据，如工资条、银行转账记录、劳动合同、工作记录等。这些证据将是你申请劳动仲裁的重要依据。
- 及时申请：不要拖延时间，一旦发现用人单位存在变相扣工资的行为，应尽快向当地劳动仲裁委员会申请仲裁。因为劳动仲裁有时效限制，超过时效可能就无法维护自己的权益了。
- 寻求帮助：如果你对劳动仲裁的流程或相关法律问题不了解，可以寻求专业律师的帮助。我可以为你提供专业的法律咨询和代理服务，帮助你更好地维护自己的权益。
可能的法律后果
如果用人单位被认定存在变相扣工资的行为，那么它可能需要承担以下法律后果：
- 补发被扣的工资及可能的利息或赔偿金。
- 如果行为构成违法，用人单位还可能面临行政处罚或刑事责任。
总之，变相扣工资是违法行为，你有权通过劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。