结论前置：疾病治疗期满两年并不意味着必须解除劳动合同，是否解除需根据职工的医疗期、恢复工作能力以及是否被确认丧失劳动能力等因素综合判断。

一、医疗期内的保护

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，可享受三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，除非职工存在严重违反规章制度等特定情形，否则用人单位不得解除劳动合同。若违法解除，职工可要求继续履行合同或要求二倍经济补偿的赔偿金。

二、医疗期满后的处理

1. 若职工不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作：
   • 用人单位在提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同。
   • 解除劳动合同的同时，用人单位需按照《劳动合同法》第四十七条的规定支付经济补偿，即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

计算公式：

• 经济补偿 = 工作年限 × 月工资（工作年限满一年按一年计，不满六个月按半个月计）

1. 若职工在医疗期满后能从事原工作或用人单位另行安排的工作：
   • 用人单位则不能以职工患病为由解除劳动合同。

三、特殊情形下的处理

• 若职工被确认丧失劳动能力：
  • 根据相关法律法规，用人单位在支付经济补偿和医疗补助费后，也可以解除劳动合同。具体补偿标准可能因地区和政策而异，需参照当地相关法规执行。

四、实际操作建议

1. 对于用人单位：

   • 在解除劳动合同前，应充分评估职工的医疗期、恢复工作能力以及是否被确认丧失劳动能力等因素。
   • 遵循法定程序，提前通知职工并支付相应的经济补偿和医疗补助费（如适用）。
   • 确保解除劳动合同的合法性和合理性，避免违法解除带来的法律风险。

2. 对于职工：

   • 了解自身权益，包括医疗期的时长、经济补偿的计算方法等。
   • 在必要时，可依法维护自身合法权益，如要求继续履行合同、要求支付赔偿金等。

五、案例说明

假设某职工因患病需要停止工作医疗，其在本单位工作年限为五年，根据规定可享受六个月的医疗期。若该职工在医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，且用人单位决定解除劳动合同，则用人单位需提前三十日以书面形式通知该职工，并支付五个月工资作为经济补偿（假设该职工月工资为5000元，则经济补偿为25000元）。

综上所述，疾病治疗期满两年并不意味着必须解除劳动合同，而是需根据具体情况综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。