在合同纠纷仲裁中，一般不可以直接申请测谎鉴定。以下是对这一问题的详细分析：
法律依据与仲裁原则
法律依据：
- 目前，我国并没有明确的法律规定在仲裁程序中可以直接进行测谎鉴定。仲裁程序主要依据的是双方当事人签订的仲裁协议以及相关的仲裁规则进行。
仲裁原则：
- 仲裁遵循自愿、公平、公正、独立的原则。仲裁庭在裁决案件时，主要依据的是双方当事人提供的证据和事实，以及适用的法律。
- 测谎鉴定作为一种特殊的证据形式，其准确性和可靠性在学术界和实务界都存在一定的争议。因此，仲裁庭通常不会主动采用测谎鉴定作为裁决的依据。
测谎鉴定的性质与适用
测谎鉴定的性质：
- 测谎鉴定，又称心理测试鉴定，是通过一定的仪器设备记录被测试者在回答问题时的生理变化，从而判断其是否说谎的一种技术手段。
- 然而，测谎鉴定并不能直接证明案件事实，它只能提供一种参考性的意见，即被测试者在回答问题时是否存在说谎的可能性。
测谎鉴定的适用：
- 在刑事诉讼中，测谎鉴定有时会被用作辅助侦查手段，但其结果并不能作为定罪的直接证据。
- 在民事诉讼和仲裁程序中，测谎鉴定的适用更加有限。由于仲裁程序的私密性和高效性要求，仲裁庭通常不会采用这种可能引发争议且耗时较长的证据形式。
合同纠纷仲裁中的证据规则
证据种类：
- 在合同纠纷仲裁中，双方当事人可以提交书证、物证、视听资料、电子数据、证人证言、鉴定意见等证据来支持自己的主张。
- 鉴定意见通常指的是由具有专业知识的第三方机构或专家出具的，对案件中的专门性问题进行分析和判断的意见。
证据的采纳与认定：
- 仲裁庭在裁决案件时，会根据双方当事人提供的证据和事实，以及适用的法律，对证据的采纳与认定进行综合判断。
- 对于测谎鉴定这种特殊的证据形式，由于其准确性和可靠性存在争议，且可能引发不必要的争议和延误仲裁程序，仲裁庭通常不会采纳。
实际操作建议
收集其他证据：
- 在合同纠纷仲裁中，如果双方当事人对某一事实存在争议，建议积极收集其他类型的证据来支持自己的主张，如书证、物证、证人证言等。
咨询专业律师：
- 如果对仲裁程序或证据规则存在疑问，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。当然，作为专业律师，我也非常乐意为你提供这方面的帮助。
尊重仲裁庭的裁决：
- 无论仲裁庭是否采纳测谎鉴定或其他证据，双方当事人都应尊重仲裁庭的裁决结果，并按照裁决结果履行自己的义务。
综上所述，在合同纠纷仲裁中，一般不可以直接申请测谎鉴定。如果双方当事人对某一事实存在争议，建议积极收集其他类型的证据来支持自己的主张，并及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。