结论：父亲可以写遗嘱将商铺指定由儿子继承，但需满足法定形式和实质要件。以下从法律要件、形式要求、特殊情形及实践建议四个角度展开说明：
一、法律要件：遗嘱有效的核心条件
根据《民法典》第一千一百三十三条，自然人可通过遗嘱处分个人财产，并指定法定继承人中的一人或数人继承。商铺作为父亲的个人财产，完全可以通过遗嘱指定由儿子继承。但需同时满足以下条件：
- 行为能力：父亲立遗嘱时需具备完全民事行为能力（如意识清醒、未受精神疾病影响）；
- 意思表示真实：遗嘱内容需体现父亲真实意愿，排除受欺诈、胁迫的情形（《民法典》第一千一百四十三条）；
- 必留份规则：若儿子是唯一继承人，则无需保留其他份额；但若父亲还有其他缺乏劳动能力且无生活来源的继承人（如未成年子女、无收入配偶），则需为该继承人保留必要遗产份额（《民法典》第一千一百四十一条）。
示例：若父亲有商铺和存款，遗嘱中仅将商铺给儿子，但未为无劳动能力的配偶保留存款份额，则遗嘱中关于存款的部分可能无效。
二、形式要求：遗嘱需符合法定类型
遗嘱形式直接影响效力，商铺遗嘱可选择以下方式之一：
| 遗嘱类型 |
核心要求 |
| 自书遗嘱 |
父亲亲笔书写遗嘱全文、签名并注明年月日（无需见证人） |
| 代书遗嘱 |
需两名无利害关系见证人在场，其中一人代书，全体签名并注明年月日 |
| 打印遗嘱 |
需两名无利害关系见证人在场，逐页签名并注明年月日 |
| 录音录像遗嘱 |
需两名无利害关系见证人在场，记录姓名/肖像及年月日 |
| 公证遗嘱 |
经公证机构办理，效力最高但非必需 |
关键提示：
- 若选择自书遗嘱，必须由父亲亲笔书写（打印后签名无效）；
- 代书、打印、录音录像遗嘱的见证人需与继承无利害关系（如不能是儿子、儿媳等）；
- 公证遗嘱不再具有优先性，最后一份有效遗嘱为准（《民法典》第一千一百四十二条）。
三、特殊情形：需额外注意的法律规则
商铺产权清晰性：
- 若商铺为父亲与他人共有（如与配偶共同所有），则父亲仅能处分自己份额，需其他共有人同意或通过析产明确产权；
- 若商铺存在抵押、查封等权利限制，需在遗嘱中说明处理方式（如用其他财产清偿债务后继承）。
多份遗嘱冲突：
- 若父亲曾立过其他遗嘱（如将商铺给女儿），则以最后一份有效遗嘱为准；
- 若遗嘱内容模糊（如“商铺给儿子但未明确份额”），可能引发争议，建议明确表述。
胎儿利益保护：
- 若儿子有未出生的子女（胎儿），遗嘱中需为胎儿保留份额；胎儿娩出时为死体的，保留份额按法定继承处理（《民法典》第十六条）。
四、实践建议：降低遗嘱无效风险
- 明确财产信息：在遗嘱中写明商铺的具体地址、产权证号，避免因信息模糊导致执行困难；
- 保留证据：妥善保管遗嘱原件，若采用代书、录音录像等形式，可同步录制立遗嘱过程；
- 定期更新遗嘱：若商铺价值发生重大变化（如拆迁补偿），或家庭关系变化（如新增继承人），建议及时修订遗嘱；
- 咨询专业律师：若商铺涉及复杂产权（如继承取得、赠与取得）或家庭矛盾，可委托律师起草遗嘱并见证，确保法律效力。
总结：父亲写商铺遗嘱给儿子在法律上完全可行，但需严格遵守形式和实质要件。建议根据家庭情况选择合适的遗嘱类型，并注意必留份、产权清晰等特殊规则。如有疑问，可直接向我咨询具体操作细节。