结论：教师病假超过两个月，学校对其进行职称高职低聘是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断，包括学校的规章制度、病假期间的工资待遇、职称聘任的合同约定以及相关法律法规的规定等。以下从不同角度进行分析：
一、学校规章制度与合同约定
学校规章制度：
- 学校作为用人单位，有权根据自身的教育教学需要和管理要求，制定内部的规章制度，包括职称聘任、病假管理等方面的规定。
- 如果学校的规章制度中明确规定了病假超过一定期限后，可以对教师进行职称高职低聘，并且该规章制度已经经过合法程序制定并公示，那么学校在执行时可能具有一定的合法性基础。
合同约定：
- 教师与学校之间签订的劳动合同或聘任合同中，可能包含关于职称聘任、病假待遇等方面的具体约定。
- 如果合同中明确约定了病假超过一定期限后，学校有权对教师进行职称高职低聘，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么学校在执行时可能也具有一定的合法性。
二、病假期间的工资待遇
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规，职工在病假期间享有相应的医疗期，并且医疗期内用人单位不得解除劳动合同，同时应当按照规定支付病假工资或疾病救济费。
- 如果学校在教师病假期间未按照规定支付工资或救济费，或者以职称高职低聘为由降低教师的工资待遇，那么这种行为可能构成违法。
三、职称聘任的合法性
职称聘任的依据：
- 职称聘任应当基于教师的专业能力、教学成果、师德表现等多方面因素进行综合评价，并且应当遵循公平、公正、公开的原则。
- 如果学校仅仅因为教师病假超过两个月就对其进行职称高职低聘，而忽略了其他重要的评价因素，那么这种聘任行为可能缺乏合法性。
职称聘任的程序：
- 职称聘任应当遵循一定的程序，包括申请、评审、公示等环节。
- 如果学校在职称聘任过程中未按照规定的程序进行，或者存在违规操作的情况，那么聘任结果可能无效。
四、相关法律法规的适用
- 在判断学校职称高职低聘行为是否违法时，还需要考虑相关法律法规的适用。例如，《劳动法》、《劳动合同法》、《教师法》等法律法规都可能对教师的权益保护、职称聘任等方面作出规定。
- 如果学校的行为违反了相关法律法规的强制性规定，那么这种行为就是违法的。
建议与措施
审查学校规章制度和合同约定：
- 教师应当仔细审查学校的规章制度和与学校签订的劳动合同或聘任合同，了解其中关于职称聘任、病假待遇等方面的具体约定。
与学校沟通协商：
- 如果教师认为学校的职称高职低聘行为违法或不合理，可以与学校进行沟通协商，寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 如果沟通协商无果，教师可以向当地的劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
最后，教师病假超过两个月后学校对其进行职称高职低聘是否违法，需结合具体情况判断。如果你面临此类问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。