职工长期病假超过医疗期本身并不直接构成违法，但具体是否违法需结合医疗期的时长、病假申请流程以及劳动合同的管理等多方面因素来综合判断。以下从几个关键角度为你详细分析：
一、医疗期时长与计算
医疗期时长：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期的时长根据职工的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定，从三个月到二十四个月不等。例如，实际工作年限十年以下，本单位工作年限五年以下的为三个月；五年以上为六个月。实际工作年限十年以上的，医疗期则更长，最长可达二十四个月。
医疗期计算：
- 医疗期是按累计病休时间计算的。如三个月的医疗期，是在六个月内累计病休时间达到三个月即算作医疗期满。这一规定确保了职工在医疗期内有足够的时间进行治疗和休息。
特殊疾病医疗期：
- 对于患特殊疾病（如癌症、精神病、瘫痪等）的职工，在24个月内尚不能痊愈的，经企业和劳动主管部门批准，医疗期可以适当延长。这体现了法律对特殊疾病职工的特别关怀。
二、病假申请流程与待遇
病假申请流程：
- 职工请长期病假需提供医疗机构出具的证明，并按照公司规定流程申请。这是确保病假真实性和合理性的重要环节。
病假期间待遇：
- 病假期间，职工应享受一定的工资待遇。具体标准根据劳动合同、集体合同或用人单位与职工代表的协商确定，但不得低于本市最低工资标准的80%。若无任何约定，则按劳动者本人所在岗位正常出勤月工资的70%确定，且不得低于最低工资标准。此外，职工还应享受住房和伙食补贴、特殊工作环境下的津贴以及社会保险福利等。
三、劳动合同管理
解除限制：
- 在规定的医疗期内，用人单位不得依照《劳动合同法》的相关规定解除劳动合同。这是为了保护患病职工的合法权益，避免其在医疗期内因失业而加重经济负担。
合同续延：
- 劳动合同期满时，若职工仍处于医疗期内，劳动合同应自动延续至医疗期满。这确保了职工在医疗期内不会因劳动合同到期而失去工作保障。
医疗期满后的处理：
- 医疗期满后，若职工不能从事原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位可以解除劳动合同，但应发给不低于六个月工资的医疗补助费。对于患重病和绝症的职工，医疗补助费还应适当增加。
四、违法情形分析
- 若职工在医疗期内：用人单位不得随意解除劳动合同或降低工资待遇，否则将构成违法。
- 若职工医疗期已满：且不能从事原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位可以解除劳动合同，但需支付医疗补助费。若用人单位未支付医疗补助费或未按照法定程序解除劳动合同，则可能构成违法。
- 若职工未按照公司规定流程申请病假：或提供的医疗机构证明不真实，用人单位有权拒绝批准病假或按照公司规定处理，但这并不直接构成职工违法。
建议：
- 对于职工而言，应了解自己的医疗期时长和病假申请流程，确保在医疗期内享受应有的待遇和保障。
- 对于用人单位而言，应严格遵守相关法律法规，确保在医疗期内不随意解除劳动合同或降低工资待遇，并在医疗期满后按照法定程序处理劳动合同解除事宜。
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