结论：旷工时绩效工资和加班工资是否全扣完并不一定合法，这取决于公司的规章制度、劳动合同的约定以及旷工的具体情况。
分析：
公司规章制度与劳动合同的约定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，公司有权制定规章制度来管理员工，包括旷工的处理方式。但这些规章制度必须合法、合理，并且已经向员工公示或告知。
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了旷工时绩效工资和加班工资的扣除方式，并且这种方式不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照这些规定扣除工资可能是合法的。
旷工的具体情况：
- 旷工的严重性、频率以及是否对公司造成了实际损失等因素，都会影响公司对旷工员工的处理方式。
- 如果旷工行为轻微，且未对公司造成实际损失，公司全额扣除绩效工资和加班工资可能显得过于严厉，甚至可能构成违法。
- 另一方面，如果旷工行为严重，且对公司造成了重大损失，公司可能会根据规章制度或劳动合同的约定，采取更严厉的措施，包括全额扣除绩效工资和加班工资。
法律法规的强制性规定：
- 即使公司的规章制度或劳动合同中有相关规定，也不能违反法律法规的强制性规定。例如，公司不能无故克扣员工的工资，包括绩效工资和加班工资。
- 如果公司扣除工资的行为违反了法律法规的强制性规定，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
建议：
- 对于员工：如果因旷工被公司扣除绩效工资和加班工资，首先应查看公司的规章制度和劳动合同中的相关规定，了解自己的权益和义务。如果认为公司的扣除行为不合法或不合理，可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
- 对于公司：在制定规章制度和劳动合同时，应确保相关规定合法、合理，并且已经向员工公示或告知。在处理旷工员工时，应根据旷工的具体情况、公司的规章制度以及法律法规的强制性规定，采取合理、合法的措施。
可能后果：
- 如果公司扣除工资的行为合法且合理，员工可能需要接受扣除的结果。
- 如果公司扣除工资的行为违法或不合理，员工可能通过投诉或劳动仲裁获得相应的赔偿或恢复被扣除的工资。
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