离职时因旷工被扣工资是否合法，需根据具体情况综合判断。以下是从不同角度进行的分析：
合法情况
规章制度合法且明确：
- 用人单位应依法制定规章制度，明确旷工的扣薪标准，且该制度需经过民主程序制定（如职工代表大会讨论），并向劳动者公示或告知（如通过员工手册、邮件通知等方式）。
- 若规章制度合法有效，且扣薪标准合理（如按旷工天数扣减相应工资，且不超过当月工资的20%），则用人单位有权扣除旷工期间的工资。
劳动合同中有明确约定：
- 双方劳动合同中明确约定了旷工的扣薪条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定。
- 在此情况下，用人单位按照合同约定扣除旷工工资是合法的。
旷工给用人单位造成实际损失：
- 劳动者旷工导致用人单位遭受实际经济损失（如因旷工导致生产延误、客户流失等）。
- 用人单位能够证明损失的存在以及损失与旷工行为之间的因果关系。
- 在此情况下，用人单位可以要求劳动者赔偿损失，并从工资中扣除相应赔偿款，但扣除幅度需符合法律规定（如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%）。
不合法情况
规章制度不合法或未公示：
- 用人单位的规章制度未依法制定，或未经民主程序讨论，或未向劳动者公示。
- 在此情况下，规章制度中关于旷工扣薪的规定可能无效，用人单位扣除旷工工资的行为可能不合法。
扣薪幅度不合理：
- 即使有规章制度或劳动合同约定，但如果扣薪幅度明显过高（如旷工一天扣除一个月工资），严重超出劳动者旷工给单位造成的损失，这种扣薪行为也是不合法的。
无经济损失且无相关约定：
- 用人单位没有因劳动者旷工而遭受实际经济损失，或者劳动合同中没有相关扣薪约定。
- 在此情况下，用人单位不得随意克扣劳动者的工资，否则将构成非法克扣工资。
法律建议
劳动者角度：
- 在离职时，若因旷工被扣工资，应先与用人单位沟通协商，了解其扣薪依据和理由。
- 若认为扣薪行为不合法，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
用人单位角度：
- 在制定和执行劳动纪律时，应确保规章制度合法有效，并向劳动者公示或告知。
- 在扣除旷工工资时，应确保扣薪幅度合理，并符合法律法规的规定。
法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《工资支付暂行规定》第十六条：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
总结来看，离职时因旷工被扣工资是否合法，取决于用人单位的规章制度、劳动合同约定以及劳动者旷工给用人单位造成的实际经济损失。在处理此类问题时，建议双方均遵循法律法规的规定，确保扣薪行为的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。